Existe uma maneira de rastrear e-mails, para que ninguém possa detectar que os e-mails estão sendo rastreados?

Não.

Se o e-mail for rastreado, ele deve comunicar essas informações em algum lugar e, portanto, deve deixar algum tipo de pegada.

Você pode usar truques como uma imagem única (ou seja, a imagem está apenas no e-mail para um destinatário) e observar o servidor da Web para ver se a imagem é acessada, mas isso só funcionará se o usuário carregar as imagens no e-mail, o que nem sempre acontece, o que você experimentou com o thunderbird. A quantidade de conteúdo carregado é decidida pelas configurações do usuário e, portanto, não é algo que você possa controlar.

Algumas empresas fornecerão um link em um e-mail 'não consegue ler este e-mail? clique aqui para ver online' que é basicamente a mesma coisa, mas em vez de uma imagem online eles apresentam todo o conteúdo dos e-mails novamente, sob o pretexto de 'ajudar você' quando na verdade é tudo sobre rastrear você.

Resposta curta: Não .

Resposta mais longa:
o recurso para carregar conteúdo remoto somente após o usuário permitir, é implementado principalmente para proteger sua privacidade. Claro que existem efeitos como menos uso de dados e talvez algumas pessoas não queiram ter tantas imagens em um e-mail, mas o principal motivo para esse recurso é a proteção de dados.
Quando houvesse uma maneira de contornar isso (um recurso para você como remetente e pessoa que deseja rastrear o e-mail), isso seria um bug no recurso de proteção e o desenvolvedor do programa de e-mail o corrigiria o mais rápido possível.

Então, o que você está pedindo é um hack ou exploit, que permite contornar as medidas de segurança no software cliente. Pode haver respostas para softwares específicos, mas todos eles seriam bugs de segurança no software e podem ser fechados mais cedo ou mais tarde.

Outra observação:

Existe uma maneira de rastrear e-mails de forma indetectável, para que ninguém possa detectar que os e-mails estão sendo rastreados?

Você não acha que esse comportamento é meio sorrateiro? Pode até violar o GDPR. Se você deseja relatórios de entrega, basta solicitar ao usuário.

Existe até um recurso no padrão de e-mail para isso, que deve ser compatível com GDPR, porque o padrão diz que o software de e-mail deve perguntar ao usuário antes de enviar o relatório. Se você deseja uma IU unificada em diferentes programas de e-mail, adicione um link " Clique aqui para confirmar que recebeu a mensagem ".

Se você é um blogueiro ou proprietário/operador de site e está tentando descobrir quais dos seus e-mails as pessoas abrem com mais frequência (sim, para aqueles com mentes superdesconfiadas, é uma coisa e, portanto, rastrear e-mails tem um propósito diferente de apenas sendo a maneira como algum hacker nefasto persegue as pessoas!), e você acha que está perdendo algum ponto de dados, tente enviar um e-mail mais pessoal e perguntar às pessoas. Você ficaria surpreso com quantos respondem apenas à humanidade básica. Enfim, desculpe não ter ajudado mais. Espero que você resolva isso.