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Gigiux's questions

Martin Hope
Gigiux
Asked: 2023-10-18 16:18:11 +0800 CST
  • 5

我有一个文件entry.txt，其文本如下

$ cat entry.txt 
>Main entry
This is some text to try
how to substitute the first
line of the text.

我想通过搜索字符来替换第一行>并添加一些存储在变量中的文本：

$ var=TITLE
$ sed -i "s/>*/$var/" entry.txt 
$ cat entry.txt 
TITLEMain entry
TITLEThis is some text to try
TITLEhow to substitute the first
TITLEline of the text.

我怎么能够

  1. >替换包含且不>单独的整行

  2. 只替换第一行而不替换其他行？

谢谢。

shell-script
Martin Hope
Gigiux
Asked: 2022-01-13 10:04:19 +0800 CST
  • 1

我想在启动 shcell 时获得一个选项值。我写：

optstring=hcnxl:
V=0
 
while getopts $optstring opt; do
  case $opt in
    h) V=1 ;;
    c) V=2 ;;
    n) V=3 ;;
    x) V=4 ;;
    l) V=$OPTARG ;;
    *) echo -e "wrong synthax" && exit 1 ;;
  esac
done
shift $((OPTIND-1))
echo :: ${OPTARG} : $OPTARG

但是当我使用该选项运行脚本时，-l <n>该选项始终为空。

我怎么了？

谢谢

bash shell-script
Martin Hope
Gigiux
Asked: 2021-11-16 04:13:41 +0800 CST
  • 0

我在一个文件中有一系列标题，其名称如下：

grep ">scaffold_3" DM_v6.1_unanchoredScaffolds.fasta 
>scaffold_3
>scaffold_303
>scaffold_31
>scaffold_34
>scaffold_36
>scaffold_37
>scaffold_39
>scaffold_33
>scaffold_300

我只想选择第一个，所以我尝试了：

$ grep ">scaffold_3 " file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3[[:blank:]]" file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3\t" file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3\ " file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3 " file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3[[:space:]]" file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3$" file.fasta 
>scaffold_3

鉴于名称后面的字符可能是空格、制表符、换行符（也可能来自 Windows）并且[[:space:]]不起作用，我如何才能获得确切的名称而不是同义词？

谢谢

grep whitespace