主页 / unix / 问题 / 718134
Accepted
compbiostats
Asked: 2022-09-22 09:02:30 +0800 CST

使用 GNU sed 在字符串之间添加下划线

  • 772

GNU sed新手来了...

我有几个 FASTA 文件（50K），标题格式为

CYTC2889-12|Homo sapiens

我想用下划线得到

CYTC2889-12|Homo_sapiens

并将结果写入文件。

我在 macOS 上运行

我试过了

 sed -i.bak 's/\s/_/g' file.fas

但这给了

>CYTC2889-12|Homo _apien_

这很接近，但不正确

有什么想法吗？

sed macos

1 个回答

  1. Best Answer

    你应该试试：

    sed -i'.bak' 's/[[:space:]]/_/g' file.fas

    我正在使用 Linux，因此GNU sed它可以使用，sed -i 's/\s/_/g'但如果我使用sed --posix -i 's/\s/_/g'该命令将无法正常工作。

    因此，在 Linux 中，如果我想使用 posix，我必须使用：

    sed --posix -i'.bak' 's/[[:space:]]/_/g'  file.fas
    • 2

相关问题