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user977828
Asked: 2019-12-28 22:19:33 +0800 CST

cut 命令似乎在管道中不起作用

  • 772

我可以通过以下方式过滤掉卡在我们的排队系统中的工作：

> qjobs | grep "racon" 
       5240703 racon-3/utg001564l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5241418 racon-3/utg002276l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :02   
       5241902 racon-3/utg002759l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5242060 racon-3/utg002919l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :04   
       5242273 racon-3/utg003133l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5242412 racon-3/utg003270l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :04   
       5242466 racon-3/utg003325l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03

但是，qjobs | grep "racon" | cut -d " " -f2没有返回例如racon-3/utg003325l-racon-3.fasta。我错过了什么？

grep cut

3 个回答

  1. Best Answer

    每个空格都计入字段编号，甚至包括前导和连续的。因此，您需要使用-f9而不是-f2. 或者，您可以awk '{ print $2 }'完全使用 cut 命令代替。

    • 25

  2. 如果输出的间距是一致的

    qjobs | grep "racon" | cut -c 16-47

    会产生像这样的输出

    racon-3/utg002276l-racon-3.fasta

    如果你想要第一列，它看起来像一个 PID 或其他标识符，那么：

    qjobs | grep "racon" | awk ' { print $1 } '

    如果您正在寻找 类似于用户名的utg002276l部分：

    qjobs | grep "racon" | awk -F'[/-]' ' { print $3 } '

    这使得 awk 使用斜杠和破折号作为字段分隔符，然后打印第三列。

    • 1

  3. 您可以将所有空间压缩为一个：

    qjobs | grep "racon" | tr -s ' ' | cut -d " " -f3
    • 0

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