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Alex
Asked: 2018-12-14 13:40:12 +0800 CST

sed 或 awk：删除符号后的数字

  • 772

我想只删除“>”符号后的数字和“_”，例如：

>1_CR-B_CR56_t
MTKIIKFVYFMTIFISPNHHCPVYNCTHPKQPWCKLVRLQLLFHGSLIGLCDCI
>2_R-B_R46_t
MVEVTKLVNVMLIFLTLSPLVYDCQAYECELPFKPDCLMVEYSPQFVALRCGCV
>3000_N-N274_M
MVEVTKLVNVMLIFLTLFVYTDSDCQAYACELPFKPDCLMVEYAPQFFRLACGCV

预期成绩：

>CR-B_CR56_t
MTKIIKFVYFMTIFISPNHHCPVYNCTHPKQPWCKLVRLQLLFHGSLIGLCDCI
>R-B_R46_t
MVEVTKLVNVMLIFLTLSPLVYDCQAYECELPFKPDCLMVEYSPQFVALRCGCV
>N-N274_M
MVEVTKLVNVMLIFLTLFVYTDSDCQAYACELPFKPDCLMVEYAPQFFRLACGCV

我用过sed "s/>[0-9][_]//g"，但它也删除了“>”。

awk sed

3 个回答

  1. Best Answer

    sed只需对您的命令稍作修改：

    sed 's/^>[0-9]\+[_]/>/g'

    这s是 sed替换命令，它搜索左侧的字符串并将其替换为右侧的字符串。>您可以将其替换为您想要保留的字符，而不是用任何内容替换它。

    ^用于指定匹配只应从换行符的开头开始

    此外，*用于匹配多个数字。

    • 8 
  2. awk '{sub(/^>._|^>...._/,">")}1' file
>CR-B_CR56_t
MTKIIKFVYFMTIFISPNHHCPVYNCTHPKQPWCKLVRLQLLFHGSLIGLCDCI
>R-B_R46_t
MVEVTKLVNVMLIFLTLSPLVYDCQAYECELPFKPDCLMVEYSPQFVALRCGCV
>N-N274_M
MVEVTKLVNVMLIFLTLFVYTDSDCQAYACELPFKPDCLMVEYAPQFFRLACGCV
    • 1 
  3. command:sed 's/^>[0-9]\{1,9\}\_/>/g' filename

    输出

    >CR-B_CR56_t
MTKIIKFVYFMTIFISPNHHCPVYNCTHPKQPWCKLVRLQLLFHGSLIGLCDCI
>R-B_R46_t
MVEVTKLVNVMLIFLTLSPLVYDCQAYECELPFKPDCLMVEYSPQFVALRCGCV
>N-N274_M
MVEVTKLVNVMLIFLTLFVYTDSDCQAYACELPFKPDCLMVEYAPQFFRLACGCV
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