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user3138373
Asked: 2017-12-14 10:02:09 +0800 CST

用制表符作为分隔符在bash中将一行拆分为数组

  • 772

我有一个以下格式的文件，它是制表符分隔的

a   k   testis  adult   male    8 week  rRNA
b   k   testis  adult   male    8 week  rRNA
c   k   testis  adult   male    8 week  rRNA

我想在每一行上做一些操作，所以我使用了一个 while 循环。我想在选项卡上分割每一行，然后存储让我们说第 6 列8 week在一个变量中。我正在使用此代码，但我无法得到我想要的

while read -r line; do tmp=(${line///}); col6=${tmp[5]}; echo "$col6"; done < file.txt

这给了我8而不是8 week。8 周在 8 和周之间有一个空格，因此我想在选项卡上拆分行。

bash array

1 个回答

  1. Best Answer

    数组赋值tmp=(${line///})将值拆分为IFS包含的任何字符，默认情况下包括制表符、空格和换行符。（我看不到空替换的作用。）要仅在选项卡上拆分，请设置IFS为：

    foo=$'a\tk\testis\tadult\tmale\t8 week\tRNA'
IFS=$'\t'
tmp=($foo)
echo "${tmp[5]}"

    虽然这仍然是一个问题，并且由于您已经在使用while read，您可以使用read -a tmp（仅在 Bash 中，用 ksh/zsh/yash 替换-a）-A，它基于 拆分输入行IFS，并将结果字段存储为命名数组：

    $ while IFS=$'\t' read -r -a tmp ; do
    echo "${tmp[5]}"
done <<< $'a\tk\testis\tadult\tmale\t8 week\tRNA'

    打印出来8 week。这样做的另一个好处是，更改IFS仅在 的持续时间内有效，read对脚本的其余部分无效。

    但是请注意，read使用制表符作为分隔符时会删除空字段。在zsh中，您可以替换IFS=$'\t'为IFS=$'\t\t'以阻止这种情况发生。

    当然，如果我们知道字段的数量/含义，我们可以read将它们拆分为单独的命名变量：

    ... IFS=$'\t' read -r col1 col2 col3 ...

    或者，如果您只想打印那一列，请使用cut：

    cut -d$'\t' -f 6  < file.txt

    如果您有空列，cut -d$'\t'并且IFS=$'\t'对它们有不同的行为。Cut 会将每个单独的选项卡视为不同的分隔符，而read将连续的选项卡视为单个分隔符。也就是说，字符串foo<tab><tab>bar将被读取为两列 by read，但三列 by cut。

    您无法为制表符更改此设置，但打印字符始终被识别为不同的分隔符，因此您可以将制表符更改为未出现在数据中的某个字符，然后将其用作分隔符，例如... | tr '\t' : | IFS=: read -r -a tmp左右。

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