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问题[rm](unix)

Martin Hope
Paulo Sergio Schlogl
Asked: 2023-08-30 01:50:01 +0800 CST
  • 5

我有这个脚本，我想在其中添加一行，在串联后，安全地删除 *.dump 文件，因为它们很大，而且我没有空间用于串联文件和转储文件。jelly 是一个 txt 文件，其中包含一行一行的基因组 ID 列表，如下所示：

GCA....
GCA....and so on.

我有一堆转储文件名，以基因组 id 命名，有两列：例如。GCA...1.dump 就像：

A 57575757
C 6656565..

前任。GCA...2.dump 就像：

AA 6565656
AT 6565656...

所以我有每个基因组 ID 的 14 个转储文件（1-14 ngrams）。因此，我想为每个基因组 ID 连接所有 1-14，然后删除基于 jelly 文件的使用过的转储文件。最后，我只需要在创建的新目录中有一个名为 *.counts 的文件。

#! usr/bin/env bash

dir_in=$1 # Jelly_count
super=$2 # Archaea/Bacteria
group=$3 # Asgard_group/Pseudomonadota
sub=$4 # Aquificota
dir_out=Counts/"${super}"/"${group}"/"${sub}"/CHR

if [ ! -d "${dir_out}" ]; then
  mkdir -p "${dir_out}"
fi
# read the ids in jelly file
for id in $(cat "${dir_in}"/"${super}"/"${group}"/"${sub}"/jelly);
do
  echo "Concatenating files from genome ${id}"
  # make a loop from 1 to 14 or any other range I need
  for i in $(seq $5 $6);
    do
      # concatenate all 14 tsv files in one
      csvtk concat "${dir_in}"/"${super}"/"${group}"/"${sub}"/CHR/"${id}"_"${i}".dump >> "${dir_out}"/"${id}"_chr_kmer.counts
     # then delete all the 14 dump files
     # MAYBE ?????
     **find "${dir_in}"/"${super}"/"${group}"/"${sub}". -name '*.dump' -delete**
    done
    
done

我尝试过rm，但还有更好的方法吗？

谢谢你们。

保罗

rm
Martin Hope
user67275
Asked: 2023-04-29 08:12:16 +0800 CST
  • 6

我了解到 -i 选项是交互模式，-f 选项是 rm 命令中的强制模型。

当我尝试这两种选择时

rm -if test.txt

它没有问我，只是删除了它，这意味着 -f 选项覆盖了 -i 选项。

当然，我不会在现实生活中同时使用选项 -i 和 -f。但是我想知道如果同时使用两个相互矛盾的选项是否有优先级。

我在 Ubuntu 22.04 中试过这个。

rm
Martin Hope
elbarna
Asked: 2022-10-28 04:09:45 +0800 CST
  • 6

今天备份 rsync 给我一个关于 dir($HOME.cache/doc/by-app) 的错误

我已经检查过了，我看到了

首先我去目录

cd $HOME.cache/doc$ cd by-app/

我做 ls 和..

ls
/bin/ls: error while loading shared libraries: libcap.so.2: cannot read file data: Error 21

我做cd..

cd ..

我控制目录树并制作命令文件以查看包含的内容

find by-app/
by-app/
by-app/libcap.so.2
find by-app/ |parallel file
by-app/: directory
by-app/libcap.so.2: directory

我要删除！

rm -vfr by-app/
rm: impossible to remove 'by-app/libcap.so.2': Operation not permitted

我以root身份执行此操作！

sudo rm -frv .cache/doc/by-app
Password: 
rm: impossible to remove '.cache/doc/by-app': Permission denied

这是什么？

系统是 Slackware64 15.0

rm
Martin Hope
Bojan Hrnkas
Asked: 2022-09-30 04:56:22 +0800 CST
  • 6

如何删除这个大目录？

stat session/
  File: ‘session/’
  Size: 321540096       Blocks: 628040     IO Block: 4096   directory
Device: 903h/2307d      Inode: 11149319    Links: 2
Access: (0755/drwxr-xr-x)  Uid: (    0/    root)   Gid: (    0/    root)
Access: 2022-09-29 14:34:40.910894275 +0200
Modify: 2022-09-29 14:35:09.598400050 +0200
Change: 2022-09-29 14:35:09.598400050 +0200
 Birth: -

请注意，目录的大小（不是内容，而是目录条目本身）超过 300MB。 inode 数量超过 1100 万。

该目录没有子目录，只有大量文件。

通常的命令都不起作用。我试过这些：

  • rsync -a --delete empty_dir/ session/
  • rm -rf session
  • find . -type f --delete

如果我跑ls -f1进去，它就会挂起。

如果我跑mv -- * ../.tmp_to_delete进去，它就会挂起。

如果我跑du进去，它就会挂起。

目前 rsync --delete 已经运行了两天，读取速度高达 7MB/s，我看到目录的 stat 输出没有变化。

我认为目录的大尺寸是问题所在。

rm delete
Martin Hope
h0ch5tr4355
Asked: 2022-07-08 05:35:56 +0800 CST
  • 1

在共享机器上不知何故创建了一个目录;（里面有很多东西）。

我只有对这台机器的 shell 访问权限，所以我不能使用任何 GUI 文件资源管理器来删除该文件。

rm -rf ;

导致奇怪的行为，因为分号可能充当命令分隔符并且不被评估为目录的名称。

rm -rf ./; rm：拒绝删除'.' 或“..”目录：跳过“./”

rm：拒绝删除'.' 或“..”目录：跳过“./”

此外，我不想删除其他目录，所以我不愿意玩通配符和其他东西。

如何以递归方式安全地删除该分号目录？

bash rm
Martin Hope
DefenestrationDay
Asked: 2022-05-21 04:05:12 +0800 CST
  • 16

我不知道是什么创建了这个文件——我猜是一个糟糕的 shell 脚本。

它被称为'.env'$'\r'

我已经尝试过各种版本的rm，以及使用 打开目录vim ./、选择文件和 Shift-D 删除的技术。
这没有用，失败了

**warning** (netrw) delete(/root/squawker/.env) failed!
NetrwMessage [RO]
"NetrwMessage"  --No lines in buffer--

如何删除这个讨厌的文件？

这是在 Ubuntu 20.04 上

filenames rm
Martin Hope
Mike
Asked: 2022-04-16 16:27:22 +0800 CST
  • 0

我有这样的文件：“轨迹”，你好，“落叶松”......等

如何删除包含单引号 (') 字符的文件（例如： "kibosh's" ）。

我正在考虑使用 grep 查找带有单引号 (') 字符的文件并使用 rm 删除文件。

有什么建议么？

grep rm