我想使用下面的代码在脚本中解析多个getopts参数bash。
while getopts b:B:m:M:T flag
do
case "${flag}" in
b) rbmin=${OPTARG};;
B) rbmax=${OPTARG};;
m) mbmin=${OPTARG};;
M) mbmax=${OPTARG};;
T) sigType=${OPTARG};;
esac
done
echo $rbmin,$rbmax,$mbmin,$mbmax, $sigType
[amit@amitk]$ sh pass.sh -b 0.1 -B 0.3 -m 10 -M 11 -T sig
0.1,0.3,10,11,
我不知道为什么我不能传递超过四个参数。有什么建议么？
我必须检查特定参数是否可以说“java8”存在于我的脚本的 shell 参数中，如果存在则删除它。我还希望它存储在其他变量中，但希望将其从我的 $*.
一个选项我尝试使用 getopts 检查 arg 是否存在，但我不知道如何删除参数。
请注意 - 用于检查 'java8' 的 arg 位置未知 我可以在任何地方
while getopts "f:" flag
do
case $flag in
f)
echo $OPTARG
;;
esac
done
echo $*
~
所以基本上当我调用 -
./test.sh arg1 arg2 -f java8 arg3
执行 getopts 块后，剩余的 args 将是
参数 1、参数 2、参数 3
考虑：
#!/bin/sh
while getopts ":h" o; do
case "$o" in
h )
"Usage:
sh $(basename "$0") -h Displays help message
sh $(basename "$0") arg Outputs ...
where:
-h help option
arg argument."
exit 0
;;
\? )
echo "Invalid option -$OPTARG" 1>&2
exit 1
;;
: )
echo "Invalid option -$OPTARG requires argument" 1>&2
exit 1
;;
esac
done
这个调用返回not found为什么？
$ sh getopts.sh -h
getopts.sh: 12: getopts.sh: Usage:
sh getopts.sh -h Displays help message
sh getopts.sh arg Outputs ...
where:
-h help option
arg argument.: not found
还行吧：
$ sh getopts.sh arg
对于这个，我期待“无效选项”：
$ sh getopts.sh
还行吧：
$ sh getopts.sh -s x
Invalid option -s
我正在尝试运行以下脚本getopts来解析选项，但它似乎不起作用：
#!/bin/bash
set -x
echo $@
while getopts "rf" opt
do
case "${opt}" in
r)
ropt=${OPTARG}
;;
f)
fopt=${OPTARG}
;;
esac
done
shift $((OPTIND -1))
echo $fopt $ropt
我得到的输出是：
$ ./myscript.sh -f opt2 -r opt1
+ echo -f opt2 -r opt1
-f opt2 -r opt1
+ getopts rf opt
+ case "${opt}" in
+ fopt=
+ getopts rf opt
+ shift 1
+ echo
+ set +x
你对我做错了什么有任何想法吗？
shift如果有人澄清了在这个简单的解析器代码中使用的必要性，我会很高兴：
while getopts ":hp:" option
do
case "${option}" in
p)
some_parameter=${OPTARG}
;;
h)
print_usage_and_exit 0
;;
*)
print_usage_and_exit 1
;;
esac
done
shift $(( OPTIND - 1 ))
例如，我不清楚：
为什么似乎不需要shift循环内部？
访问是否会getopts移动参数本身，或者它是如何工作的？
为什么需要shiftafter getopts？
我不明白为什么getopts最后不会自己这样做。
我正在尝试制作具有两个开关的脚本 -h 和 -d, -d 具有强制数字参数。之后，将有未确定数量的文件路径。到目前为止，我有这个，但代码似乎无法识别无效的开关 -r （可以是任何名称）并且当我不输入任何开关时也不起作用：
while getopts ":hd:" opt; do
case $opt in
h)
echo $usage
exit 0
;;
d)
shift 2
if [ "$OPTARG" -eq "$OPTARG" ] ; then # ako dalsi argument mame cislo
depth=$OPTARG
fi
;;
\?)
shift 1
;;
:)
shift 1
;;
esac
done
echo $1
当我输入
时，当我输入时，我只./pripravne1.sh -d /home/OS/test_pz/test2得到空字符串。./pripravne1.sh: [: /home/OS/test_pz/test2: integer expression expected./pripravne1.sh -r /home/OS/test_pz/test2
我有一个大型脚本，它依赖于输入参数（使用 getopts）。其中一个参数是一个包含文件的目录（所有文件都命名为 *bam） 这个脚本有两个部分：
现在，从计算的角度来看，part1 最初非常快。所以我的设置是：
然而，现在我需要分析比原计划更多的文件，我意识到第 1 部分的计算量也很大——因此我还需要在 HPC 上运行它。
所以我的问题是：
明确地说，这是我的脚本的示例：
#!/usr/bin/bash
# PART 0: accept all input arguments
USAGE() { echo "Usage: bash $0 [-b <in-bam-files-dir>] [-o <out-dir>] [-c <chromlen>]" 1>&2; exit 1; }
if (($# == 0)); then
USAGE
fi
# Use getopts to accept each argument
while getopts ":b:o:c:h" opt
do
case $opt in
b ) BAMFILES=$OPTARG
;;
o ) OUTDIR=$OPTARG
;;
c ) CHROMLEN=$OPTARG
;;
h ) USAGE
;;
\? ) echo "Invalid option: -$OPTARG exiting" >&2
exit
;;
: ) echo "Option -$OPTARG requires an argument" >&2
exit
;;
esac
done
# PART1: calculate this unique number
NUMBER=0
for i in $(ls $BAMFILES/*.bam)
do
make some calculations on each file to obtain a number ...
keep only the smallest found number and assign its value to $NUMBER
done
echo "Final number is ${NUMBER} "
# PART2: Using $NUMBER that we found above, submit a job for each *bam file
for i in $(ls $BAMFILES/*bam)
do
if [ ! -f ${OUTDIR}/${SAMPLE}.bw ];
then
command=" command -options -b $NUMBER $i"
echo $command | qsub -V -cwd -o $OUTDIR -e $OUTDIR -l tmem=6G -l h_vmem=6G -l h_rt=3600 -N result_${SAMPLE}
fi
done
按照惯例--，这表明它之后没有更多选择。在我看来，当使用getoptswithcase子句时，-)模式子句不匹配--。那么getopts它遇到时的行为是什么--？它是否将其--视为一个选项、一个非选项参数，或者两者都不是？谢谢。
在使用时的选项字符串中getopts，来自http://wiki.bash-hackers.org/howto/getopts_tutorial
如果选项字符串的第一个字符是 :（冒号），这通常是无意义的，因为它前面没有选项字母，getopts 切换到“静默错误报告模式”。在生产性脚本中，这通常是您想要的，因为它允许您自己处理错误而不会被烦人的消息干扰。
我想知道以下是什么意思：
“静默报错模式”
“它允许您自己处理错误而不会被烦人的消息打扰”？
你能举一些例子吗？