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lotus
Asked: 2022-11-12 04:53:32 +0800 CST

如何根据名称与文件夹的对应关系移动文件？

  • 772

我有这个父目录 X 和这两个子目录 A 和 B（见图 1）：在此处输入图像描述文件夹 A 包含特定主题的文件，我想将这些文件移动到文件夹 B 中的其他相应文件夹。例如，在文件夹 A 中，我有很多不同主题的文件以不同的扩展名结尾（eeg.eeg、eeg.json、eeg.vhdr 和 eeg.vmrk）（参见照片 2）。在此处输入图像描述

我想为每个主题获取所有这些文件并将它们移动到 B 的子文件夹，其中有一个所有主题的子文件夹：B>>“subject_id”>>ses-t1>>eeg。目标文件夹应该是每个参与者文件夹中的“eeg”文件夹。在此处输入图像描述.

所需的结果应如下图所示（照片 3）： 在此处输入图像描述

好处是，我认为文件夹 A 中文件的起始名称与主题子文件夹名称相对应。例如，文件以sub-CDPC0001 _ses-01_task-rest_eeg.eeg 开头，类似于文件夹 B ( sub_CDPC0001)中此特定主题的主题文件夹

过去，有一个用于此的迷你脚本，但我认为现在这种安排不能正常工作：

for dir in $(ls -d */ses-t1); do
find "./$dir/" -name '*_eeg.eeg' -exec mv {} "$dir/eeg" \;
find "./$dir/" -name '*_eeg.vhdr' -exec mv {} "$dir/eeg" \;
find "./$dir/" -name '*_eeg.vmrk' -exec mv {} "$dir/eeg" \;
find "./$dir/" -name '*_eeg.json' -exec mv {} "$dir/eeg" \;
#find "./$dir/" -name '*_anat.nii.gz' -exec mv {} "$dir/t1" \;
done

这会列出文件夹 A 中的所有文件，但无法将它们移动到所需的 eeg 文件夹中。非常感谢您的回答，因为有很多数据，手动移动它们很容易出错并且非常繁琐。

linux

1 个回答

  1. Best Answer

    首先，安装 perlrename实用程序。您似乎使用的是 Mac，因此您可能需要使用brew，它打包了 perl rename - 请参阅https://formulae.brew.sh/formula/rename。

    安装完成后，您应该可以运行以下命令：

    $ find A/ -regex '.*_eeg.\(eeg\|vhdr\|vmrk\|json\)' \
    -exec rename -n 's=^.*/(sub-[^_]*)_=B/$1/eeg/$1_=' {} +

    注意：我不确定find这些天在 Mac 上安装的是哪个版本。我假设它是 FreeBSD 的版本find并且有一个-regex谓词。如果没有，请使用brew安装 GNUfind并使用它代替默认的 Mac find。如果没有-regex，您可以通过对几个 -name 谓词进行 OR 运算来做到这一点（在括号中强制优先）：

    find A/ \( -name '*_eeg.eeg' -o -name '*_eeg.vhdr' -o -name '*_eeg.vmrk' -o -name '*_eeg.json' \) -exec rename ...`

    另请注意，重命名的-n选项使其成为空运行，因此它只会显示它会做什么而不会实际重命名任何文件。当您确认它执行您想要的操作时，删除-n，或将其替换为以获得详细输出。-v如果它不太正确，请修改重命名脚本，直到它按照您的需要工作。

    顺便说一句，这假设 B/ subject / 和 B/ subject /eeg/ 已经存在。如果他们不这样做，并且您希望重命名脚本在重命名文件之前创建目录，请在s===替换操作之前立即插入以下内容。

    if (m=^.*/(sub-[^_]*)_=) { mkdir "B/$1"; mkdir "B/$1/eeg" };

    样本运行（只有一个文件名，因为我懒得从你的命令文本图片中touch输入更多文件名，但如果它们存在于我的 A 中，它也可以与 .vhdr、.vmrk 和 .json 文件一起使用/ 目录）：

    $ mkdir -p A B/sub-CDPC0001/eeg/
$ touch A/sub-CDPC0001_ses-01_task-rest_eeg.eeg

$ find A/ -regex '.*_eeg.\(eeg\|vhdr\|vmrk\|json\)' \
    -exec rename -v 's=^.*/(sub-[^_]*)_=B/$1/eeg/$1_=' {} +
A/sub-CDPC0001_ses-01_task-rest_eeg.eeg renamed as B/sub-CDPC0001/eeg/sub-CDPC0001_ses-01_task-rest_eeg.eeg
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