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arara
Asked: 2022-05-23 10:21:46 +0800 CST

如何从 BLAST 数据库目录中获取所有 Betacoronavirus .tar.gz 文件？

  • 772

我正在尝试使用 wget 从https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/下载所有以 .tar.gz 结尾的 Betacoronavirus 文件。我可以使用 wget 并将链接粘贴到这些文件中的一个，它会很好地下载它。但是当我尝试使用某种正则表达式时，例如带有 Betacoronavirus.*.tar.gz 的东西为我一次下载它们，它不起作用。我已经尝试了很多我在其他线程上看到的东西，但仍然没有工作。

wget

2 个回答

  1. Best Answer

    使用专为传输文件而非文本而设计的协议。在这种情况下，主机名“ftp”表明您也可以通过 FTP 访问资源。wget 可以通过 FTP 进行 glob：

    wget 'ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov:21/blast/db/Betacoronavirus.*.tar.gz'
    • 3

  2. Betacoronavirus.*.tar.gz当您在 wget 命令行上使用“regex”或“glob”时，它会在您当前工作目录中的本地计算机上执行。

    wget Betacoronavirus.*.tar.gz

    在那个目录中，可能没有这样的文件并且“glob”是空的；或者，目录可能包含一些已下载的文件，然后“glob”可能会匹配该文件并尝试下载相同的文件。

    无论哪种方式，这都行不通。

    您需要的是远程 ftp 机器上的 glob 。您可以通过使用cli ftp 客户端来获得它。
    您最好的方法（简单方法）是使用gui ftp 客户端并选择匹配的文件并单击下载。我推荐WinSCP 和 FileZilla。

    高级方法是下载目录列表的 html 源代码，解析它并取出匹配的文件并在每个匹配的文件上执行 wget。鉴于您的用例，我不建议这样做。

    • 0

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