我想为我正在开发的脚本使用两个参数和第三个可选参数。我是使用 bash 的新手,所以我一直在复制并尝试理解以下代码,它可以满足我的需求(我猜)
while [[ $# -gt 0 ]]; do
case $1 in
-f1|-fasta1)
FASTA1=$2
shift
;;
-f1=*|-fasta1=*)
FASTA1=${1#*=}
;;
-d|-directory)
DIRECTORY=$2
shift
;;
-d=*|-directory=*)
DIRECTORY=${1#*=}
;;
-f2|fasta2)
FASTA2=$2
shift
;;
-f2=*|-fasta2=*)
FASTA2=${1#*=}
;;
-*)
echo "Invalid option: $1" >&2
exit 1
;;
--)
# Do FILES+=("${@:2}") maybe
break
;;
*)
# TODO
# Do FILES+=("$1") maybe
;;
esac
shift
done
问题是这段代码有很多部分我真的不明白什么是例如 the -gt
或 the1#*=
或为什么每个参数需要写两次第一行
-f1|-fasta1)
FASTA1=$2
shift
和两个
-f1=*|-fasta1=*)
FASTA1=${1#*=}
有人可以告诉我在哪里可以找到对此的解释。我一直在阅读教程,但使用更简单的示例我无法理解这一点。
您发布的代码确实是一种非常“手动”的解析命令行参数的方式。
getopt
使用和/或getopt_long
用于该目的通常被认为是良好的做法。另请注意,只有一个破折号(如-fasta1
)引入“长选项”是不寻常的;通常你会期望它们前面有两个破折号(另请参阅这个关于命令行参数格式的问题)。也就是说,您看到的大部分内容是基本的 shell 语法,即字符串操作、
case
语句和测试结构。该
[[ $# -gt 0 ]]
语句只是一个测试,其中检查$#
包含命令行参数数量的特殊参数是否大于 (-gt
) 零。这被用作while
循环中的条件,因为参数处理例程使用在处理shift
后丢弃第一个命令行参数的语句,从而连续减少参数的数量。处理完所有参数后,需要完成选项处理循环。至于其他问题:程序希望允许用户在可能的语法变量中指定第一个 FASTA 文件,即:
程序通过“手动”迭代命令行参数来做到这一点,即它总是检查“当前第一个”参数(
$1
)是什么,解释它,然后使用shift
命令丢弃它(所有命令行参数移动“增加一个数字”)。为了同时接受“short”和“long”选项名称,该
case
语句同时接受-f1
and-fasta1
(对于空格分隔的语法)和两者(对于 - 分隔-f1=*
的-fasta1=*
语法=
)作为当前参数。但是,它需要根据语法对选项的“值”部分进行不同的处理。$1
为-f1
或-fasta1
。程序知道选项的“值”然后在下一个命令行参数$2
中,因此它将内容分配给$2
变量FASTA1
。也需要额外shift
丢弃下一个命令行参数,因为它已经在此迭代中处理。=
-separated 语法,第一个 FASTA 文件的语句通过$1
匹配-f1=*
或来识别-fasta1=*
。这意味着选项的“值”是当前值的一部分,$1
需要通过字符串操作来提取。该声明 表示“返回 的值,但从值的开头$variablename
删除匹配的最短字符串”。所以,pattern
表示“返回 的值$1
,但从开头删除匹配的最短字符串*=
”,有效地从值中剥离-f1=
或-fasta1=
。剩下的是文件名。如果您想更深入地了解 shell 编程,我会推荐GreyCat&Lhunath 的 Bash Guide以供进一步阅读。