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Anna1364
Asked: 2020-02-01 16:13:48 +0800 CST

基于除标题之外的另一个文件对文本文件进行排序

  • 772

我有一个文件，其中第一列和第二列是个人 ID，其余是基因型信息（我应该提到每个人有两行）。该文件有一个标题行，但仅适用于基因型列，而不是个人 ID 的第一列和第二列）。

        SNP_1 SNP_2 SNP_3 SNP_4 SNP_5
2014TOR010  1   3 1 4 4 3 3 2 3 1
2014TOR010  1   1 1 2 4 3 3 2 4 1 
06SELI0115  1   3 1 4 4 3 3 2 3 1  
06SELI0115  1   3 1 2 4 3 2 2 3 2
2014TOR011  1   3 1 4 4 3 3 2 3 1 
2014TOR011  1   1 1 2 4 1 3 2 4 2 
....

我想根据另一个文件对该文件进行排序：

head sorted.snps.txt
2014TOR011
06SELI0115
2014TOR010

但我想保留标题。这是我想要的输出：head out.desired

      SNP_1 SNP_2 SNP_3 SNP_4 SNP_5
2014TOR011  1   3 1 4 4 3 3 2 3 1 
2014TOR011  1   1 1 2 4 1 3 2 4 2
06SELI0115  1   3 1 4 4 3 3 2 3 1  
06SELI0115  1   3 1 2 4 3 2 2 3 2
2014TOR010  1   3 1 4 4 3 3 2 3 1
2014TOR010  1   1 1 2 4 3 3 2 4 1 
....
awk text-processing

1 个回答

  1. Best Answer

    未经测试：

    awk '
NR==1 { print; next }
NR==FNR { a[$1]=($1 in a ? a[$1] ORS : "") $0; next }
{ print a[$1] }
' file1 sorted.snps.txt
    • 3

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