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Konrad Rudolph
Asked: 2019-12-04 06:21:05 +0800 CST

为什么我不能在块中的地址之后对 sed 命令进行分组？

  • 772

我正在尝试使用sed打印所有行，直到但不包括特定模式。我不明白为什么以下不起作用：

sed '/PATTERN/{d;q}' file

根据我对 sed 脚本的理解，这个表达式应该会导致以下情况：

  • 当一行匹配/PATTERN/时，执行由命令组成的组
    1. d删除模式空间（= 当前行）
    2. q打印当前模式空间后的uit

孤立地，两者都/PATTERN/d起作用/PATTERN/q；也就是说，d删除有问题的行，并q导致在打印该行之后sed终止，如记录的那样。但是将这两个操作组合在一个块中似乎会导致被忽略。q

我知道我可以使用Q而不是{d;q}作为 GNU 扩展（这可以按预期工作！）但我有兴趣了解为什么上述内容不起作用，以及我以何种方式误解了文档。

我的实际用例（只是稍微）复杂一些，因为文件的第一行实际上与模式匹配，我跳过了它（在做了一些替换之后）：

sed -e '1{s/>21/>chr21/; n}' -e '/>/{d;q}' in.fasta >out.fasta

但是上面的简化案例表现出相同的行为。

sed

3 个回答

  1. Best Answer

    要输出文件的所有行直到匹配特定模式（并且不输出匹配的行），您可以使用

    sed -n '/PATTERN/q; p;' file

    在这里，每个循环结束时模式空间的默认输出被禁用-n。相反，我们用 . 显式输出每一行p。如果给定的模式匹配，我们用 停止处理q。

    您的实际更长的命令，它将 21 号染色体的名称从 just 更改21为chr21fasta 文件的第一行，然后继续提取该染色体的 DNA 直到它到达下一个 fasta 标题行，可以写为

    sed -n -e '1 { s/^>21/>chr21/p; d; }' \
       -e '/^>/q' \
       -e p <in.fasta >out.fasta

    或者

    sed -n '1 { s/^>21/>chr21/p; d; }; /^>/q; p' <in.fasta >out.fasta

    您的原始表达式的问题是d开始一个新的循环（即，它强制将下一行读入模式空间并且跳转到脚本的开头）。这意味着q永远不会被执行。

    请注意，为了在非 GNU 系统上语法正确，您的原始脚本应该看起来像/PATTERN/ { d; q; }. 注意;后面的添加q（空格不重要）。

    • 14

  2. d不只是删除模式空间：来自POSIX 规范

    [2addr]d

    删除模式空间并开始下一个循环。

    （我的重点）

    该q命令无法访问。

    • 9

  3. 您可以使用双地址形式获得相同的输出（仅在第一个匹配之前的那些行）：

    sed -e '/PATTERN/,$d'

    但与 using 的方法不同q，这意味着sed继续读取每一行输入。这可能会对大型输入文件或从管道读取时产生影响。

    • 1

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