nohup：忽略输入并将输出附加到“nohup.out”

$ type -a nohup
nohup is /usr/bin/nohup

Nohup 不是 shell 语法的一部分。它只是一个可执行文件，这意味着您不能只键入任意命令并为其添加前缀nohup以期望它在忽略 SIGHUP 的情况下执行。如果是

nohup conda activate shuffle_pair_end_reads && python3 shuffle_pair_end_reads.py \
    fastp-filtered-merged4racon/merge_R1.fq.gz \
    fastp-filtered-merged4racon/merge_R2.fq.gz \
    >fastp-filtered-merged4racon/merged_R1_R2.fa \
    2>merged_R1_R2.log &

nohup使用参数conda,activate和执行shuffle_pair_end_reads。第一个之后的所有&&内容都是另一个简单的命令。nohup对它一无所知，也无法控制它的行为。

正如它所写的那样，这意味着执行conda activate shuffle_pair_end_reads忽略SIGHUP，然后如果nohup成功，则处理到python脚本。

至于 stdin 和 stdout 的重定向，man page 已经说得很清楚了。

如果标准输入是终端，则将其从 /dev/null 重定向。如果标准输出是终端，则尽可能将输出附加到“nohup.out”，否则附加到“$HOME/nohup.out”。如果标准错误是终端，则将其重定向到标准输出。要将输出保存到 FILE，请使用“nohup COMMAND > FILE”。

在你的情况下，你的命令的输入没有被重定向，所以nohup从/dev/null. 同样，为您nohup重定向标准输出nohup.out，发出警告（注意这只是一个警告）“忽略输入并将输出附加到'nohup.out'”并将警告写入stderr。

至于退出状态nohup，这个问题很好解释。您需要自己检查为什么该命令nohup conda activate shuffle_end_reads发出退出状态1。

nohup就好像它是语法的一部分一样使用bash可能会导致有趣的错误。最简单的一种，

nohup cd myfolder && ./script.sh &

将失败，并将以下消息写入 stderr：

nohup：忽略输入并将输出附加到“nohup.out”

nohup：无法运行命令“cd”：没有这样的文件或目录

第一行只是一个警告。第二行解释了错误。nohup只是尝试将其$1作为可执行文件调用，而cd绝不是独立的可执行文件。

当我需要组合多个命令时nohup，我通常使用语法

nohup bash -c "long command" &

可能有更好的方法，但这就是我使用的方法。在上面的例子中，如果真的有你cd之前做不到的原因nohup，我会做

nohup bash -c "cd myfolder && ./script.sh` &

最后要记住的一件事是，您的程序可能会安装自己的信号处理程序，而这会变得nohup无用。如this question所示。