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Asked: 2019-02-19 08:48:13 +0800 CST

如何提取字符串

  • 772

我的数据如下

sp|Q9H9K5|MER34_HUMAN(9-21)
sp|Q9H9K5|MER34_HUMAN(493-507)
sp|Q9H9K5|MER34_HUMAN(524-539)
sp|P31689|DNJA1_HUMAN(22-33)
sp|P31689|DNJA1_HUMAN(66-82)
sp|P31689|DNJA1_HUMAN(93-104)
sp|P08246|ELNE_HUMAN(7-27)
sp|P08246|ELNE_HUMAN(72-83)
sp|P10144|GRAB_HUMAN(5-13)

我正在尝试提取之间的字符串||

sed -n " ||" file
grep "||" file

不工作 。

欲望输出是这样的

Q9H9K5
Q9H9K5
Q9H9K5
P31689
P31689
P31689
P08246
P08246
P10144

然后我想让它们独一无二

 Q9H9K5
 P31689
 P08246
 P10144
awk text-processing

2 个回答

  1. 你可以cut在这里使用效果很好。

    cut -d\| -f2 myfile.txt

    产生以下输出：

    Q9H9K5
Q9H9K5
Q9H9K5
P31689
P31689
P31689
P08246
P08246
P10144

    -d 告诉cut注意管道字符以分隔输出的列（在这种情况下，我们必须对其进行转义）。-f 指定要返回输入的哪一列（或多列）。列从 1 开始编号。

    如果您只想要唯一值，则可以将该输出通过管道传输到 sort 和 uniq 中，如下所示：

    cut -d\| -f2 myfile.txt | sort | uniq

    这会产生：

    P08246
P10144
P31689
Q9H9K5
    • 3
  2. Best Answer

    您可以尝试以下方法：

    awk -F\| '{print $2}' input_file|sort -u
    • 2

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