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mf94
Asked: 2018-08-25 03:54:37 +0800 CST

基于另一个关联数组制作关联数组

  • 772

我制作了一个关联数组，如下所示。为了提供一些细节，这些键是指特定的文件，因为我将在一个更大的脚本的上下文中使用这个数组（其中包含文件的目录将是一个 getopts 参数）。

declare -A BAMREADS
echo "BAMREADS array is initialized"

BAMREADS[../data/file1.bam]=33285268
BAMREADS[../data/file2.bam]=28777698
BAMREADS[../data/file3.bam]=22388955

echo ${BAMREADS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMREADS[@]} # Output: ../data/file1.bam ../data/file2.bam ../data/file3.bam

到目前为止，这个数组的行为似乎符合我的预期。现在，我想基于这个数组构建另一个关联数组。具体来说：我的第二个数组将具有与第一个数组相同的键，但我想将这些值除以一个名为 $MIN 的变量。

我不确定以下哪种策略是最好的，我似乎无法使任何一种工作。

策略一：复制数组并修改数组？

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"
BAMFRACS=("${BAMREADS[@]}")

echo ${BAMFRACS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMFRACS[@]} # Output: 0 1 2

这不是我想要的钥匙。即使它有效，我也需要对所有值执行我提到的操作。

策略2：在循环第一个数组时构建第二个数组。

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"

for i in $(ls $BAMFILES/*bam)
do
    echo $i
    echo ${BAMREADS[$i]}
    BAMFRACS[$i] = ${BAMREADS[$i]} 
done

echo ${BAMFRACS[@]}
echo ${!BAMFRACS[@]}


#When I run this, I get the following error which I am unsure how to solve:

../data/file1.bam
33285268
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file1.bam]: No such file or directory
../data/file2.bam
28777698
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file2.bam]: No such file or directory
../data/file3.bam
22388955
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file3.bam]: No such file or directory

谢谢

bash associative-array

3 个回答

  1. Best Answer

    从旧数组构建新数组：

    MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
for key in "${!BAMREADS[@]}"; do
    BRAMFRACS[$key]=$(( ${BAMREADS[$key]} / MIN ))
done

    对您的代码的评论：

    • 您的第一个建议代码不起作用，因为它将关联数组中的值复制到新数组中。这些值会自动获取键 0、1 和 2，但不会复制原始键。如上所示，您需要逐键复制数组。这样您就可以将所需的值分配给正确的键。

    • 您的第二个建议代码包含语法错误，因为它=在赋值中有空格。这就是您看到的错误的来源。 variable = value被解释为“使用操作数和”variable执行的命令。=value

    • 如果您希望遍历一组路径名，请不要使用ls. 相反，只是做for pathname in "$BAMFILES"/*bam; do。

    • 引用你的变量扩展。

    • 考虑使用printf而不是echo输出可变数据。

    有关的：

    • 7

  2. 回答有关复制关联数组的更一般的问题。

    当bash维护者在 4.0 中引入他们自己的关联数组时，他们做出了一个不幸的决定来复制 ksh93 API 而不是 zsh API。

    ksh93/bash确实支持将关联数组设置为一个整体，但它与：

    hash=([k1]=v1 [k2]=v2)

    句法。而与zsh，它是

    hash=(k1 v1 k2 v2)

    （([k]=v...)为了兼容性，后来还添加了对 ksh93 语法的支持）。

    这意味着使用 ksh93 和 bash，从任意键和值列表中创建散列是非常棘手的。

    使用该zsh语法，您只需将列表作为交替的键和值传递。例如，要复制两个关联数组：

    h2=("${(@kv)h1}")

    或者来自具有两列的 CSV：

    IFS=$'\n,'; h=($(<file.csv))

    或者来自键和值的数组：

    h=("${(@)keys:^values}")

    使用ksh93/bash语法，虽然有"${!h[@]}"and"${h[@]}"可以扩展为键和值列表（如"${(@k)h}"和"${(@v)h}"in zsh），但没有运算符可以扩展为( in ) 所[key]=value期望的语法中的键和值。h=(...)"${(@kv)h}"zsh

    您可以在这些 shell 中使用的一个技巧来复制关联数组（除了在循环中复制元素），就是使用typeset -p.

    例如，复制到zsh's的等价物可以通过以下方式完成：h2=("${(@kv)h1}")h1h2ksh93bash

    h1_definition=$(typeset -p h1) &&
  eval "typeset -A h2=${h1_definition#*=}"

    您可以将其bash缩短为：

    h1_definition=$(typeset -p h1) &&
  typeset -A h2="${h1_definition#*=}"

    （虽然像在 ksh93 中一样，typeset -A h=value是typeset -A h=([0]=value)in的缩写bash，如果value以 开头(和结尾)，则内容被解释为复合关联赋值，就像传递给一样eval（即使(被引用或某些扩展的结果））。

    最后，使用循环同样容易：

    for k in "${!h1[@]}"; do h2[$k]=${h1[$k]}; done
    • 7

  3. 这应该可以做到（也可以添加额外的键值）：

    declare -A origDict=( [keya]=value_a [keyb]=value_b [keyc]=value_c )
declare -a newDict=( echo ${origDict[*]} [keynew]=new_value )
    • -3

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