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user3523406
Asked: 2018-06-26 15:02:40 +0800 CST

ncbi-爆炸：未找到

  • 772

我得到了ncbi-blast: not found尽管它应该在那里（https://packages.debian.org/jessie/amd64/ncbi-blast+/download）

FROM debian:jessie
# based on https://github.com/docker-library/php/blob/master/5.6/jessie/apache/Dockerfile

RUN apt-get update  && apt-get install -y --no-install-recommends \
        libapache2-mod-perl2 \
        libcgi-pm-perl \
        php5-cgi \
        php5-mysql \
        libapache2-mod-php5 \
        php5-mysql \
        php5-gd && \
        ncbi-blast+ && \
        rm -rf /var/lib/apt/lists/*

我错过了什么？

debian software-installation

1 个回答

  1. Best Answer

    正如Mark Plotnick 评论的那样，您似乎在某个时候重新排列了行，为ncbi-blast+after添加了行pgp5-gd，但是您忘记了删除&&末尾的 ，php5-gd以便下一个续行列出另一个包而不是结束上一个命令。您拥有的命令将请求安装软件包直到php5-gd，之后它将尝试执行 ncbi-blast+，可能尚未安装，因此会引发错误，之后它将不会运行该rm命令. 请改用以下内容：

    RUN apt-get update  && apt-get install -y --no-install-recommends \
        libapache2-mod-perl2 \
        libcgi-pm-perl \
        php5-cgi \
        php5-mysql \
        libapache2-mod-php5 \
        php5-mysql \
        php5-gd \
        ncbi-blast+ && \
        rm -rf /var/lib/apt/lists/*
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