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Osman Mamun
Asked: 2018-01-16 22:18:14 +0800 CST

从 shell 命令输出中取消所有 SLURM 作业的最佳方法

  • 772

我提交了很多带有调试时间限制的 SLURM 作业脚本（我忘了更改实际运行的时间）。现在它们都是同时提交的，所以它们都以作业 ID 197xxxx 开头。现在，我可以做到 

squeue -u $USER | grep 197 | awk '{print $1}'

打印我要删除的作业 ID。但是如何在所有这些 ID 上使用 scancel 命令。上述 shell 命令的输出如下所示

19726664
19726663
19726662
19726661
19726660
19726659
19726658
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19726653
19726652
19726651
19726650
shell slurm

5 个回答

  1. Best Answer
    squeue -u $USER | grep 197 | awk '{print $1}' | xargs -n 1 scancel

    有关详细信息，请查看文档xargs。如果scancel接受多个作业 ID（它应该），您可以省略该-n 1部分。

    • 29

  2. 为了取消我所有的 slurm 工作（省略 OP's grep 197），我发现我必须修剪包含列标题的 squeue 输出的第一行：

    squeue -u $USER | awk '{print $1}' | tail -n+2 | xargs scancel
    • 14

  3. 一个短一点的版本，只有由以下人员打印的作业编号squeue：

    squeue --me -h -o "%i" | xargs scancel
    • 5

  4. 由于这是一个简化的解决方案，您也可以这样做：

    squeue -u $USER -h | awk '{print $1}' | xargs scancel

    这省略了格式化选项，而是删除了带有-h标志的标题。

    • 1

  5. 这是我通常使用的：

    1. 取消我所有的工作：

      scancel -u <my_user_name>

    2. 通过过滤取消：即取消所有 jobId 以 26699 开头的作业）：

      squeue --format="%.18i" --me -h | grep -w 26699.* | xargs scancel
    • 0

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