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Paulo Sergio Schlogl's questions

Martin Hope
Paulo Sergio Schlogl
Asked: 2022-11-02 16:43:50 +0800 CST
  • 5

我有一些文件需要清理一些名称。

例如：

GCA_940670685.1_Clostridium_sp_chr  3757330
GCA_940677205.1_Clostridium_colinum_chr 2035557
GCA_942548115.1_Aeromicrobium_sp_chr    3463989
GCA_943169635.1_Fenollaria_sp_chr   3260126
GCA_943169825.1_Varibaculum_sp_chr  4423380
GCA_943736995.1_Sporosarcina_sp_chr 3771420

我需要一些这样的：

GCA_940670685.1 3757330
GCA_940677205.1 2035557
GCA_942548115.1 3463989
GCA_943169635.1 3260126
GCA_943169825.1 4423380
GCA_943736995.1 3771420

我尝试使用：

sed 's/_[A-Za-z]+_//gI' Terrabacteria_chr_lengths.tsv

sed 's/\w+_\w+_chr//gI' Terrabacteria_chr_lengths.tsv

find Results/Lengths/Bacteria -type f -exec sed -i 's/_\w+_\w+_chr//g' {} \;

但似乎没有任何效果，我认为由于我在正则表达式方面的技能不佳，例如。\w+ \w+_chr。

任何建议将不胜感激。谢谢你。

保罗

sed