几天前我已经将 R（从 3.6 升级到 4.0）和 RStudio（从 1.1 升级到 1.2.5），昨天将 Ubuntu 从 18.04 升级到 20.04。
从那时起，R有时在执行某些命令时永远不会终止：（ivreg来自 package AER）、summary（来自 logit 回归）和logitmfx（来自 package mfx）。有时这些命令运行良好，但大多数时候我必须终止进程（killall rstudio），因为 R 不会终止执行，即使按下 RStudio 中的红色停止按钮也是如此。
当我尝试example('AER')时，它工作得很好。然后我重新安装了包AER。In readLines(file, skipNul = TRUE) : cannot open compressed file '/usr/lib/R/site-library/[package]/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory'它抛出了 10 个where [package]is abind, colorspace, ...类型的警告dichromat（但不是AER）。
此后example('AER')引发警告：no help found for ‘AER’.
我已经删除并重新安装了 R 4.0：它没有帮助。此外，apt purge r-base* r-recommended r-cran-*抛出警告：dpkg: warning: while removing r-base-core, directory '/usr/lib/R/site-library' not empty so not removed. 此外，还有一堆Package [package] is not installed, so not removed，包括 for [package]equal tor-cran-abind和上面列出的另一个（这purge也返回了一堆Note, selecting [package] for glob 'r-cran-*'）。
我没有尝试在没有 RStudio 的情况下使用 R。在升级到 Ubuntu 20.04 期间，我可能正在使用 RStudio。另外，我不记得这个问题是在我升级 R 和 RStudio（这是我最好的猜测）之后还是在我升级 Ubuntu 之后（一两天后）开始的。
我希望有人能帮帮忙。