Os Docker Containers (que é basicamente isolamento de aplicativos, afaik) parecem úteis, mas são apenas para Linux. Mesmo o "Docker Container para Windows" basicamente apenas instala uma VM Linux no VirtualBox no Windows.
Então, existe uma tecnologia semelhante ao Docker Container para o Windows Server?
Ainda não, não - foi anunciado como um recurso da próxima versão do Windows Server (Windows Server 2016).
Os contêineres estão disponíveis no Windows Server 2016 Technical Preview 3 .
Para concluir a resposta, iniciando o Windows Server 2016 (Technical Preview 3 e >), você pode criar e executar contêineres baseados no Windows. O Docker Engine foi implementado no Windows Server 2016, bem como no Docker CLI. Assim, você pode gerenciar contêineres Linux e Windows com a mesma ferramenta (Docker CLI...). Para administradores de sistemas que preferem o PowerShell, também é possível gerenciar contêineres do Windows usando cmdlets do PowerShell. Apenas lembre-se de que os contêineres Linux estão sendo executados em um sistema operacional Linux (Docker Host) e os contêineres Windows em um sistema operacional Windows Server (host Docker).
Informações adicionais
Apresentando a visualização técnica do Docker Engine para Windows Server 2016 http://blog.docker.com/2015/08/tp-docker-engine-windows-server-2016/
Contêineres do Windows https://msdn.microsoft.com/virtualization/windowscontainers/containers_welcome
Cumprimentos
Estanislau