Eu costumava ddcopiar uma instalação do Ubuntu 18.04 de uma partição de 64 GB na unidade X para uma partição de 128 GB na unidade Y. Veja as imagens abaixo para o problema; Ainda estou limitado a 64 GB, apesar de ter uma partição de 128 GB.
De "Discos" (mostra o tamanho da partição)
Baobab (também conhecido como Disk Usage Analyzer)
EDIT: A resposta está abaixo. Eu costumava resize2fsaumentar o sistema de arquivos.