Embora chrome://flags/#enable-force-dark("Renderizar automaticamente todo o conteúdo da Web usando um tema escuro") seja uma opção interessante, alguns sites simplesmente não estão prontos para isso. Por exemplo, por mais difícil que seja de acreditar, o próprio Gmail do Google:
Como é uma pena não usar isso em geral por causa disso, existe uma maneira de abrir exceções para sites semelhantes?
A descrição do sinalizador indica claramente que é para TODAS as guias.
Portanto, a resposta à sua pergunta é claramente Não :)