Criar um sistema de pontos de restauração todos os dias danifica meu disco rígido?

Não há mal algum em criar pontos de restauração do sistema.

Os pontos de restauração do sistema são extremamente benéficos. Eles permitem que você volte para o momento em que foram criados, caso uma atualização do sistema dê errado, você seja infectado por um vírus ou corrija outros efeitos negativos que podem fazer com que seu sistema pare de responder.

Há um caso em que algumas pessoas podem dizer que a criação de muitos pontos de restauração do sistema é negativa: discos de estado sólido (SSD). Os discos de estado sólido têm ciclos de gravação limitados e acabarão por se desgastar. No entanto, os SSDs modernos têm uma vida útil extremamente longa e um "usuário comum" provavelmente substituirá a unidade muito antes de ela começar a falhar.

Não, isso não danificará sua unidade, a menos que você atinja o limite de armazenamento. Se você decidir substituir os dados, embora não deva, você perderá dados.