Sei que posso abrir a pasta do Menu Iniciar usando a caixa de diálogo Executar junto com shell:Common Start Menu. Meu programa está listado lá, mas não é mostrado no menu Iniciar. Aprendi que alvos duplicados são ignorados, mas esse não é o caso. Regenerei o índice também sem nenhum efeito. A reinicialização também não mudou isso. O que poderia ser? Não há ícone no alvo, pode ser esse o motivo? É um link para um arquivo uninstall.exe.
Isso ocorre por design. O Menu Iniciar do Windows 10 filtra os atalhos na pasta do Menu Iniciar usando um determinado conjunto de regras antes de mostrá-los na Lista de Aplicativos. Uma das regras, como você mencionou, é que os atalhos duplicados são ignorados. Outra é que todos os atalhos para desinstalações são ignorados, pois eles esperam que a função de desinstalação seja executada por meio das configurações.