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主页 / coding / 问题 / 79240683
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TiredSquirrel
TiredSquirrel
Asked: 2024-12-01 07:57:27 +0800 CST2024-12-01 07:57:27 +0800 CST 2024-12-01 07:57:27 +0800 CST

检查 psych fa() 函数返回的结果是否收敛?

  • 772

我正在编写一个函数,它将使用fa()“psych”包中的函数。当fa()无法收敛时,我希望我的函数丢弃结果并返回一个空图,只显示“收敛失败”。

我发现 fa() 有一个warnings=选项,当它无法收敛时会打印一条消息,但我还没有找到一种方法来以编程方式检查返回的fa()收敛结果。

在我的函数中,我通过传递fa(...)用户在调用我的函数时设置的任何选项来进行调用。因此,用户可能会使用不同的因子提取方法、不同的 max.iter 值等。

当使用主轴因子提取方法(例如fm='pa')时,返回的对象fa()包含一个由称为的迭代产生的值向量communality.iterations,因此我可以这样做:

results <- fa(...)

# Check for Principal Axis factor extraction failing to converge
fa_args <- list(...) # Capture whatever the user gave my function to pass to fa()
if('fm' %in% names(fa_args) && fa_args$fm=='pa') {
    max_iter <- ifelse('max.iter' %in% names(fa_args),fa_args$max.iter,50) # 50 is the default if not set
    if(length(results$communality.iterations)==max_iter) { # Handle convergence failure
       warning('Factor Analysis convergence failed for plot ',plot_title,'.',immediate.=T)
       return(ggplot() + theme_void() + labs(title=plot_title,subtitle='Convergence failed'))
    }
}

但这仅涵盖用户可能选择的一种因子提取方法,并且是以一种相当复杂的方式进行的。

有没有更好的方法来检查fa()结果是否未能收敛?

注意:抱歉,我无法提供可重现的示例。我可以从文档中看出,其他因子提取方法(如最大似然法)可能无法收敛,但我还没有找到实现它的方法。以下是一次未能产生有关收敛失败警告的尝试:

library('psych')

bad_corr <- matrix(0,nrow=50,ncol=50)
diag(bad_corr) <- 1
x <- fa(r=bad_corr,nfactors=8,fm='ml',warnings=T)
  • 1 1 个回答
  • 28 Views

1 个回答

  • Voted
  1. Best Answer
    Ben Bolker
    2024-12-01T09:43:13+08:002024-12-01T09:43:13+08:00

    如果没有可重现的例子会很困难,但是:

    查看代码,似乎warnings实际上会抛出消息,而不是警告(这些是不同的)。如果包在这种情况下实际上抛出了警告,则可以使用options(warn = 2)将警告升级为错误,然后使用try()或tryCatch()根据需要拦截和处理它们。

    由于这些不是警告,并且没有等效的方法来升级消息,您可以尝试使用capture.output()您的呼叫fa()并使用grep(或来自的等效工具stringr)来检测特定问题并采取适当的措施......

    • 3

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