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steve
Asked: 2015-10-08 03:56:48 +0800 CST

带文件名的for循环

  • 772

我有几个文件（表）命名为：institute _model _scenario _river.txt

（institute，model，scenario和river是变量。）我想创建一个for循环来识别每个具有相同institute名称且同时具有相同scenario名称的文件，以便附加每个不同的结果使用以下命令在同一输出文件中建模：

paste filename1.txt filename2.txt > output_file.txt

我知道如何for在不同的文件夹而不是文件名上创建循环。有人有想法吗？

作为一个最小的例子，文件名可以如下所示：

wbm_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt
wbm_hadgem_rcp8p5_mississippi.txt
matsiro_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt
matsiro_ipsl_rcp4p5_mississippi.txt
matsiro_hadgem_rcp4p5_mississippi.txt
matsiro_miroc_rcp8p5_mississippi.txt

然后，我想将以下文件附加在一起：

wbm_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt with
wbm_hadgem_rcp8p5_mississippi.txt

matsiro_ipsl_rcp4p5_mississippi.txt with
matsiro_hadgem_rcp4p5_mississippi.txt

matsiro_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt with
matsiro_miroc_rcp8p5_mississippi.txt
command-line

3 个回答

  1. for首先，目录循环和文件循环没有区别。这是完全一样的事情。请记住，在 *nix 上，一切皆文件。

    所以，你的循环将是这样的：

    for institute in institute1 institute2 institute3
do
    for scenario in scenario1 scenario2 scenario3
    do
        paste "$institute"_*_"$scenario"* > "$institute"_"$scenario".out
    done
done

    如果您不知道研究所和场景名称，您可以对所有文件运行此命令并从文件名中提取它们（只要您的名称不包含空格）：

    for f in *; do echo "${f/_*} ${f##*_}"; done | 
    sort -u | while read ins sce; do 
        paste "$ins"_*_"$sce"* > "$ins"_"$sce".out
    done
    • 6
  2. Best Answer

    如果文件都在同一个目录中，您可以：

    ls |
awk -F_ '{ i=$1; m=$2; s=$3; f[i"_"s] = f[i"_"s] " " $0 }
         END{ for(insc in f)
                printf "paste%s >out_%s.txt\n",f[insc],insc
         }'

    它在“_”( -F_) 上拆分文件名，将变量 i、m、s 设置为文件名的前 3 部分（研究所、模型、场景），并在数组 f 中累积文件名。该数组仅由研究所和场景索引，因此所有模型都被连接起来（不使用 m）。最后的 END 打印 f 数组，并使用索引 (institute_scenario) 作为输出文件的名称。根据您的示例，这会产生

    paste wbm_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt wbm_hadgem_rcp8p5_mississippi.txt >out_wbm_rcp8p5.txt
paste matsiro_hadgem_rcp4p5_mississippi.txt matsiro_ipsl_rcp4p5_mississippi.txt >out_matsiro_rcp4p5.txt
paste matsiro_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt matsiro_miroc_rcp8p5_mississippi.txt >out_matsiro_rcp8p5.txt

    然后，您需要将其通过管道传输到 shell 中以执行它。添加| sh到上面的最后一行来执行此操作。

    要从输入文件中删除某些列，您需要更改收集所有输入文件名的 awk 行。在第一行：

    { i=$1; m=$2; s=$3; f[i"_"s] = f[i"_"s] " " $0 }

    文件名是“$0”。例如，如果将此行更改为：

    { i=$1; m=$2; s=$3; f[i"_"s] = f[i"_"s] sprintf(" <(cut -f4 %s)",$0) }

    然后您将获得示例输出：

    paste <(cut -f4 wbm_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt) <(cut -f4 wbm_hadgem_rcp8p5_mississippi.txt) >out_wbm_rcp8p5.txt

    但是如果你只想剪切第二个文件名，那就有点复杂了，你需要这个：

    { i=$1; m=$2; s=$3; 
  if(f[i"_"s]=="")add = $0; else add = sprintf("<(cut -f4 %s)",$0);
  f[i"_"s] = f[i"_"s] " " add }

    所以你会得到

    paste wbm_gfdl_rcp8p5_mississippi.txt <(cut -f4 wbm_hadgem_rcp8p5_mississippi.txt) >out_wbm_rcp8p5.txt

    如果sh不理解语法<(cut ...)，则将其替换为bash.

    • 2

  3. 也许使用 ls 命令。类似的东西ls $institute_*_$scenario_*.txt应该返回具有相同机构和场景的所有文件。

    • 1

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