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Mohammad
Asked: 2021-01-22 03:26:37 +0800 CST

为什么“gedit”不能读取 *.FASTA 文件？

  • 772

我在 Linux 16.04 上分析了我的 *.fasta 文件。我想查看 *.fasta 文件的内容。所以我运行以下命令：

gedit SRR662431.fasta

阅读内容的进度将开始，但一段时间后 gedit 将关闭，我在终端中看到以下消息：

(gedit:10466): Gtk-CRITICAL **: _gtk_text_line_char_locate: assertion 'char_offset >= 0' failed

(gedit:10466): Gtk-ERROR **: Char offset -2147483648 is off the end of the line
Trace/breakpoint trap (core dumped)

如果您指导我解决此问题，我将不胜感激。

gedit

1 个回答

  1. Best Answer

    顺便说一句，这是一个生物信息学问题，因此更好地放置在像https://bioinformatics.stackexchange.com/这样的适当社区中。

    但是，答案很可能是微不足道的：您尝试查看 6.2Gb 的文件，因此您的 gedit 可能会耗尽内存。您可能想尝试less，也许与headand结合使用tail，以防您真的想通过原始测序读取。

    • 1

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