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Louis Waweru
Asked: 2020-10-22 19:44:11 +0800 CST

无法使用 fmriprep-docker

  • 772

这是我用于数据的命令：

sudo fmriprep-docker -i poldracklab/fmriprep:20.2.0 -u 131231231167:12123123231405 /data/asdf/fmri_data/sourcedata /data/asdf/fmri_data/derivatives participant --fs-no-reconall -w /data/asdf/fmri_data/scratch --output-spaces MNI152NLin2009cAsym:res-2 --participant_label asdf1 asdf2 asdf3

这是我得到的错误：

sudo: fmriprep-docker: command not found

但是，fmriprep-docker安装在服务器上。我在 fmriprep 的 sudoers 名单上吗？

sudo pip docker

1 个回答

  1. Best Answer

    做这个：

    pip3 install --user --upgrade fmriprep-docker
echo 'export PATH=$PATH:~/.local/bin' >> ~/.bash_profile
source ~/.bash_profile

    第一个命令将 fmriprep docker 安装到~/.local/bin

    其余的确保 shell 在那里寻找要运行的程序

    • 0

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