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Another.Chemist
Asked: 2020-06-17 12:55:58 +0800 CST

如何比较来自两个不同文件的两列？

  • 772

我有两个文件，内容是：

文件 1：

ATOM      1  N   LEU     1     -10.186 -21.276  -0.497  1.00  2.00      PROT
ATOM      2  HT1 LEU     1     -10.773 -22.005  -0.843  1.00  4.00      PROT
ATOM      3  HT2 LEU     1      -9.316 -21.441  -0.958  1.00  4.00      PROT
ATOM      4  HT3 LEU     1     -10.007 -21.389   0.478  1.00  4.00      PROT
ATOM      5  CA  LEU     1     -10.642 -19.924  -0.729  1.00  3.00      PROT
ATOM      6  HA  LEU     1     -10.092 -19.286  -0.214  1.00  4.00      PROT
ATOM      7  CB  LEU     1     -10.604 -19.551  -2.214  1.00  3.00      PROT
ATOM      8  HB1 LEU     1     -11.432 -19.802  -2.731  1.00  4.00      PROT
ATOM      9  HB2 LEU     1      -9.764 -19.989  -2.566  1.00  4.00      PROT
ATOM     10  CG  LEU     1     -10.447 -17.969  -2.340  1.00  3.00      PROT

文件 2：

ATOM      1  N   LEU     1     -10.186 -21.276  -0.497  1.00  2.00      PROT
ATOM      2  HT1 LEU     1     -10.773 -22.005  -0.843  1.00  4.00      PROT
ATOM      3  HT2 LEU     1      -9.316 -21.441  -0.958  1.00  4.00      PROT
ATOM      4  HT3 LEU     1     -10.007 -21.389   0.478  1.00  4.00      PROT
ATOM      5  CA  LEU     1     -10.642 -19.924  -0.729  1.00  3.00      PROT
ATOM      6  HA  LEU     1     -10.092 -19.286  -0.214  1.00  4.00      PROT
ATOM      7  CB  LEU     1     -10.604 -19.551  -2.214  1.00  3.00      PROT
ATOM      8  HB1 LEU     1     -11.432 -19.802  -2.731  1.00  4.00      PROT
ATOM      9  HB2 LEU     1      -9.764 -19.989  -2.566  1.00  4.00      PROT
ATOM     10  CG1 LEU     1     -10.447 -17.969  -2.340  1.00  3.00      PROT

我想比较两个文件中的第三列，如果它们相同，则在同一行打印第 2 列的特定匹配值和“ok”的值。否则打印第 2 列的值和“错误”。

我的第一次尝试是：

awk -F"\," 'FILENAME=="file1"{A[$3]=$3} FILENAME=="file2"{if(A[$3]){print "$2 ok"}}' file1 file2

但是，它不起作用。

command-line awk

3 个回答

  1. Best Answer

    这里的关键是“在同一行” - 这表明您需要使用当前文件中的记录号来索引数组FNR，而不是使用字段值$3

    前任。

    awk 'NR==FNR{a[FNR]=$3; next} {print $2, $3 == a[FNR] ? "ok" : "error"}' file1 file2

    或者，如果您知道第一个文件中有多少列（我们称之为N），您可以将它们并排粘贴，然后$3与$(N+3)

    前任。

    paste file1 file2 | awk '{print $2, $14 == $3 ? "OK" : "error"}'

    注意我省略了-F","因为您发布的文件是空格分隔而不是逗号分隔 - 如果它们实际上是 CSV 文件，请将其添加回来。

    • 3

  2. 使用Miller组合两个表：

    $ mlr -p join -j 2 --lp a --rp b -f file1 then \
  put -q 'print $2.(($a3 == $b3) ? " ok" : " error")' < file2
    • 1

  3. 在我看来，在使用日志和源文件几年后，使用 Visual Studio Code 中的用户界面比较文件，用于小文件。操作、创建报告等更容易。

    视觉工作室代码

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