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Alish
Asked: 2020-01-26 02:34:42 +0800 CST

nohup 和 mpirun 有什么冲突吗？

  • 772

我想在 ubuntu 台式计算机上开始一个大型模拟。我可以物理（非远程）访问这台 PC。此模拟可能需要数周时间。启动进程的命令是：

mpirun -np 100 icoFoam -parallel | tee log

icoFoam可执行文件在哪里，-parallel需要作为它的选项。
此命令在终端中打印数据。有时终端关闭或操作系统在长时间模拟期间随机注销，因此，进程终止。我试图通过几个替代命令来解决这个问题：

nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel > log  & 
nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel > log  & disown & 
nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel | tee log & disown & 
nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel | tee log & disown & > /dev/null 2>& 1 & nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel > /dev/null 2>& 1  &
systemd-run --scope --user mpirun -np 100 icoFoam -parallel | tee log &
systemd-run --scope --user mpirun -np 100 icoFoam -parallel | tee log & disown &
systemd-run --scope --user nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel | tee log & disown &
tmux

结果
除了 form tmux，使用这些命令中的任何一个，当我关闭终端时，进程都会终止。
tmux当我从我的用户帐户注销时也会终止。

我的发现

  1. 作为最简单的解决方法，我混合了nohup和disown（从这里）。
  2. 我猜想包括 , 在内的命令由于关闭终端（从这里）而tee被终止。因此，我使用重定向到日志文件或（从这里），这两者也都通过关闭终端而终止。 SIGPIPE/dev/null
  3. 我也检查了systemd-run。但它也可以通过关闭终端来终止。

  4. 为了查看程序是否安装了自己的处理程序，我执行了这个：

    nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel > log  &
grep Sig /proc/$!/status

    哪个返回

    SigIgn: 0000000000000000

    因此，我猜是这种情况，即mpirun安装了自己的处理程序来覆盖nohup（从这里）的保护。

  5. 我不知道是否可以发送自定义处理程序以mpirun不覆盖nohup.

我的问题
我想执行以下命令，以便只要终端未关闭，它就会在终端中打印输出，并且不会通过关闭终端或从用户帐户注销来终止该过程。

mpirun -np 100 icoFoam -parallel

操作系统：Ubuntu 18.04
可执行文件：OpenFOAM
mpirun（Open MPI）：2.1.1

更新
通过注销，我的意思是按注销按钮（图像），而不是锁定屏幕（super+L） 在此处输入图像描述

先感谢您。

gnome-terminal logout signal 18.04 mpi

3 个回答

  1. Best Answer

    问题是您是从桌面环境中开始工作的，因此这些工作是该桌面的子项。当桌面结束时，无论出于何种原因，所有子项也会自动结束。'nohup' 不会保存它们 - 注销会删除输出应该打印到的显示，这也会导致致命错误。

    考虑在tty而不是终端窗口中运行 tmux 。然后，无论桌面在做什么，该过程都可以永远运行。

    • 2

  2. 我在这里有相同的配置（Ubuntu 18.04、OpenFoam v7、Open MPI 2.1.1），我也面临同样的问题。唯一有帮助的解决方案是本文中描述的步骤：

    1. 使用从控制台启动窗口管理器，screen然后按 Enter。

    2. 在屏幕控制台中，您可以根据需要输入命令，pe

      nohup mpirun -np 100 icoFoam -parallel > log  &

    3. 按CtrlA和CtrlD将终端“分离”到创建的“屏幕”。

    4. 现在您应该能够在不终止mpi进程的情况下关闭终端窗口。
    5. 为了返回屏幕，打开一个新终端并输入screen -DR. 它应该打开最后一个屏幕。
    6. exit如果要退出屏幕，请在屏幕中键入。

    注释：如果您创建了多个屏幕，则screen -DR显示包含所有屏幕会话的列表。键入screen -r [session number]以转到屏幕或screen -X -S 63896 quit退出屏幕。这是一个有点笨拙的解决方法，但我希望能有所帮助，期待这个错误（或功能？）在未来的版本中得到解决。

    有关详细信息，请参阅man screen。

    • 1

  3. 第二种方法是使用在新会话setsid中运行。mpirun优点是当终端关闭（挂断信号SIGHUP）时，此会话不会被终止，正如这里一般建议的，更具体的建议这里。语法很简单：

    setsid mpirun -np 100 icoFoam -parallel > log &

    为了mpirun出于任何原因手动终止，请使用 终止其中一个icofoam进程htop，然后按并按F9发送。所有其他进程和进程也应该被杀死。或者，按此处建议的方式键入。SIGKILL9icofoammpirunkillall mpirun

    • 1

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