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vmanechini_jr
Asked: 2019-02-08 16:22:18 +0800 CST

如何仅在具有特定文件名的文件中 grep 模式？

  • 772

我花了很多时间寻找关于我的问题的现有问题，但我没有找到任何针对这种情况的具体解决方案。如果有解决它的现有线程/问题，我提前道歉，如果有人能指出我，我将不胜感激。

我必须在数据系统的众多文件中搜索一个模式（例如“GENE”）。但是，数据集命名如下：

foo_1549474392_93.nwk
foo_1549474392_93.ort.final.nwk
foo_1549474392_93.ort.nwk
foo_1549474392_93.ort_reroot.nwk

这些是用于分析 n# 93 的文本文件。总共有 550 个。问题是，我只能在名为“foo_1549474392_93.nwk”的文件中找到模式（即：任何内容 + 下划线 + 数字 + .nwk，数字从 1 到 550，而不是 001 到 550）。下划线之前的所有其他内容都无关紧要。

我已经试过了

grep "GENE" *'/d'.nwk

以及使用 [0-9] 等的许多变体。

非常感谢你的帮助！

command-line bash regex grep wildcards

1 个回答

  1. Best Answer

    要搜索名称与任何内容 + 下划线 + 数字 + .nwk 匹配的任何文件，数字从 1 到 550 不包括 001、551 等，请尝试：

    shopt -s nullglob; grep GENE  *_{1..550}.nwk

    因为{1..550}扩展为您想要的数字（并且只有您想要的数字），所以 glob*_{1..550}.nwk将仅包含您想要的文件。为了确保扩展中的所有文件实际存在于目录中，我们设置nullglob了 shopt -s nullglob.

    由于您可能不希望 nullglob 中的更改影响其他命令，因此使用括号将命令放在子 shell 中可能很有用。

    (shopt -s nullglob; grep GENE  *_{1..550}.nwk)

    nullglob 中的更改仅影响子外壳（括号内的内容），而不影响之前或之后的任何内容。

    例子

    让我们创建四个文件GENE，其中两个与您的文件名条件匹配，两个不匹配：

    $ echo GENE | tee bad_1224_01.nwk bad_3456_551.nwk good_23456_1.nwk good_763456_550.nwk
GENE
$ ls
bad_1224_01.nwk  bad_3456_551.nwk  good_23456_1.nwk  good_763456_550.nwk

    现在，让我们运行我们的命令：

    $ (shopt -s nullglob; grep GENE  *_{1..550}.nwk)
good_23456_1.nwk:GENE
good_763456_550.nwk:GENE

    排除不需要的文件并找到好名称。

    为了比较，让我们尝试：

    $ grep "GENE" *[0-9].nwk 
bad_1224_01.nwk:GENE
bad_3456_551.nwk:GENE
good_23456_1.nwk:GENE
good_763456_550.nwk:GENE

    这匹配不需要的文件。

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