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主页 / server / 问题 / 402920
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HughE
HughE
Asked: 2012-06-28 19:11:51 +0800 CST2012-06-28 19:11:51 +0800 CST 2012-06-28 19:11:51 +0800 CST

对大型二进制文件进行排序

  • 772

是否有用于对包含固定长度二进制记录的大文件进行排序的 Unix 实用程序?

换句话说,我正在寻找类似 sort(1) 的东西,但用于具有固定长度记录的二进制文件。

我可以将文件转换为文本,然后使用 sort(1) 进行排序,然后转换回二进制表示形式,但我正在寻找更节省时间和空间的东西。

unix files sort
  • 3 3 个回答
  • 3891 Views

3 个回答

  • Voted
  1. Arnaud Le Blanc
    2013-08-16T12:27:17+08:002013-08-16T12:27:17+08:00

    一种解决方案可能是将输入文件转换为十六进制,每条记录在单独的行上编码,对其进行排序,然后转换回二进制:

    record_size=32
    cat input \
        |xxd -cols $record_size -plain \
        |sort \
        |xxd -cols $record_size -plain -revert
    

    但是,它很慢(xxd 在我的机器上转换大约 40MB/s)

    所以,因为我需要它,所以我写binsort了 ,它完成了工作:

    binsort --size 32 ./input ./output
    

    对于--size 32,它假定 32 字节固定大小的记录,读取./input,将排序的记录写入./output。

    • 8
  2. mc0e
    2013-08-17T02:25:48+08:002013-08-17T02:25:48+08:00

    如果您相对于第一个“记录”引用二进制数据,则 Unix 的排序实用程序可以根据记录中的字节位置对二进制数据进行排序。例如-k1.28,1.32。

    Unix 排序在行尾概念方面不太灵活。根据您的数据,您可以进行比 user68497 建议的基于 xxd 的流编辑简单得多,并使用空终止行。这仍然可能涉及内存中的大量数据复制,并且不会接近基于 mmap 的方法的速度。

    如果您确实以某种方式使用 unix 排序,请注意语言环境。sort 假定它的输入是文本,并且语言环境会影响排序顺序。

    • 5
  3. Best Answer
    Adam DePrince
    2016-07-25T20:08:09+08:002016-07-25T20:08:09+08:00

    原来你很幸运;有一个 GNU 风格的 unix 程序可以做到这一点:bsort。

    bsort是就地基数排序的超高效实现,在处理大于 ram 的文件时特别注意内存访问模式。我所说的高效是指从 2014 年年中开始能够在硬件上打破http://sortbenchmark.org的 2014 年节能 10^8 记录排序——记录是 889 焦耳,这个的早期原型能够在普通 macbook pro 消耗 335 焦耳。对于完全适合 ram(三位数兆字节)的“小”数据集,它比 libc 的 qsort 库快大约 3 倍。

    • 2

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