Eu sinto que isso deveria ser simples. Eu tenho um diretório com mais de 1000 arquivos gzip-ed. Eu gostaria de armazená-los todos e concatená-los.
A execução gzip -dk *.gz | cat > output.fileproduz o seguinte erro:Too many levels of symbolic links
Ideias?
Preciso alimentar um programa com alguns arquivos específicos, na ordem correta e agrupados dois a dois.
Se eu tiver
A_file.txt
B_file.txt
C_file.txt
D_file.txt
Preciso alimentá-lo em um programa para que os arquivos A e B sejam processados primeiro, depois C e D e assim por diante. Em essência:
for i in *.txt; do
some_program A_file.txt B_file.txt > output_AB
some_program C_file.txt D_file.txt > output_CD
Eu sei que o acima não faz sentido, mas foi para ilustrar o ponto. Essencialmente, repita todos .txtos arquivos na pasta, mas alimente-os dois de cada vez no programa e, em seguida, passe para os próximos dois.
Olhando para aprender, muito obrigado.
Aqui está meu arquivo (na realidade, alguns milhões de linhas):
1 75
2 188
3 279
4 267
5 100
6 28
7 479
8 325
9 225
10 181
Eu quero encontrar o máximo da segunda coluna para as primeiras 5 linhas (linhas 1-5) e imprimir esse valor máximo, mas também o valor correspondente da primeira coluna. Em seguida, passe para as próximas cinco linhas (linhas 6-10) e faça o mesmo.
A saída deve ser:
3 279
7 479
Até agora eu posso calcular o máximo de rolamento desta maneira:
awk '{for(i=1;i<=NF;i++) if($i>maxval) maxval=$i;} NR%5==0 { print maxval; maxval= -1}' input.file
No entanto, não consegui imprimir o respectivo valor da primeira coluna. Tentei definir uma segunda variável como want=$1e depois tentar, print maxval, wantmas sem sucesso. Tenho uma vaga impressão de que isso poderia ser feito com matrizes, mas todas as minhas tentativas foram malsucedidas.
TP
Veja como está meu arquivo:
SRR008602 97 99 99 99 98 99 98 11
SRR009633 99 99 99 99 99 100 100 10
SRR022120 0 0 0 0 0 0 0 0
SRR026121 0 0 0 0 0 0 0 0
SRR008724 80 79 99 99 99 99 99 18
Eu gostaria de contar o número de linhas em que as colunas 2 a 9 têm um valor de "0". Prefiro uma awksolução. Aqui está o que eu inventei (e funciona), mas tenho certeza de que deve haver uma maneira melhor de fazer isso:
awk '$2 == 0 && $3 == 0 && $4 == 0 && $5 == 0 && $6 == 0 && $7 == 0 && $8 == 0 && $9 == 0 {n++}; END {print n}' input.txt