Gostaria de saber se o protocolo do servidor de exibição usado pelo meu sistema pode afetar alguns recursos do meu terminal, como
- Interação da área de transferência.
- Renderizando imagens no terminal, etc ...
Como a função principal de um protocolo de servidor de exibição é gerenciar interfaces gráficas de usuário, não tenho certeza se isso afeta o terminal.
Isso depende de como o seu emulador de terminal foi escrito. Se for um cliente X11 clássico e rodar no Wayland até o XWayland, realmente não deveria fazer diferença. (Embora haja uma pequena diferença nos tipos de pranchetas que o X11 possui. Para começar, não é um fato frequentemente observado...)
Se for mais moderno e tiver um backend Wayland, então pode cometer um erro ou omitir um recurso em um desses backends, levando a diferenças funcionais. Mas não vejo por que alguém faria isso.