O arquivo de configuração em /boot tem alguma função além de uma informação sobre a presença dos módulos?

Seu único papel é fornecer a configuração do kernel correspondente, para fins de informação. Eles não são necessários para mais nada.

(Observe que eles não fornecem apenas informações sobre a presença de módulos; eles incluem toda a configuração de compilação do kernel.)

Além da resposta de Stephen, devo dizer que, se sua distro fizer isso, isso soará antiquado e ineficiente.

A maneira preferida de armazenar a configuração do kernel hoje em dia é o vmlinuzarquivo e, em seguida, você pode obter a configuração /proc/configou extraí-la de vmlinuz, portanto, não há necessidade de ter/instalar um arquivo extra em seu disco.

O arquivo em si é indispensável, pois permite ao usuário entender quais recursos do kernel estão ativados/desativados e isso afeta como o kernel funciona ou quais recursos estão disponíveis (por exemplo iptables, quais são desativados por muitas distribuições avançadas).

Para o kernel funcionar, deve haver zero arquivos ou dispositivos de armazenamento. O bootloader pode baixar/executar vmlinuze o sistema de arquivos raiz do net/USB/ROM/whatever.