Início / unix / Perguntas / 559236
Accepted
user977828
Asked: 2019-12-28 22:19:33 +0800 CST

comando cut parece não funcionar em um pipe

  • 772

Eu sou capaz de filtrar os trabalhos que ficaram presos em nosso sistema de filas com:

> qjobs | grep "racon" 
       5240703 racon-3/utg001564l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5241418 racon-3/utg002276l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :02   
       5241902 racon-3/utg002759l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5242060 racon-3/utg002919l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :04   
       5242273 racon-3/utg003133l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03   
       5242412 racon-3/utg003270l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :04   
       5242466 racon-3/utg003325l-racon-3.fasta  H   1     1   0     10.0   0.0    150   :03

No entanto, qjobs | grep "racon" | cut -d " " -f2não retornou, por exemplo racon-3/utg003325l-racon-3.fasta. O que eu perdi?

grep cut

3 respostas

  1. Best Answer

    Cada espaço conta para o número do campo, mesmo os iniciais e consecutivos. Portanto, você precisa usar -f9em vez de -f2. Alternativamente, você pode usar awk '{ print $2 }'no lugar do comando de corte inteiramente.

    • 25

  2. Se a saída for consistente em seu espaçamento

    qjobs | grep "racon" | cut -c 16-47

    produziria uma saída como

    racon-3/utg002276l-racon-3.fasta

    Se você quiser a primeira coluna, que se parece com um PID ou algum outro identificador, então:

    qjobs | grep "racon" | awk ' { print $1 } '

    Se você está procurando a parte utg002276l que se parece com um nome de usuário:

    qjobs | grep "racon" | awk -F'[/-]' ' { print $3 } '

    Isso faz com que o awk use os caracteres barra e traço como separadores de campo e imprima a terceira coluna.

    • 1

  3. Você pode espremer todos os espaços em um:

    qjobs | grep "racon" | tr -s ' ' | cut -d " " -f3
    • 0

relate perguntas