Como posso ajustar as preferências do gedit que não aparecem mais no menu de preferências do Ubuntu 18.04

1. Abra o Gedit e clique no triângulo suspenso à direita de onde diz Editor de Texto no canto superior esquerdo da área de trabalho ao lado de Atividades.

2. Selecione Preferências no menu suspenso Editor de texto.

3. Na janela Preferências do Gedit, clique na guia Exibir .

4. Na janela Preferências do Gedit, marque a primeira opção que diz Exibir números de linha marcados pelo cursor do mouse na captura de tela abaixo.

   
   ^{Clicar em ▾ + Exibir números de linha no canto inferior direito exibe os números de linha apenas para a guia que tem o foco.}

Se você deseja apenas exibir números de linha, clique no indicador de posição do cursor na barra de status na parte inferior (que se parece com "Ln x, Col y") e marque " Exibir números de linha ".

Conforme mencionado nas respostas de @vanadium e @karel , a opção " Preferências " foi movida para o "Menu de aplicativos" na barra superior ao lado de " Atividades ". Mas, se desejar, você pode trazê-lo de volta para a janela do aplicativo usando (GNOME) Tweaks para obter um comportamento mais próximo da versão anterior.

Inicie o Tweaks e vá para a seção " Top Bar ". Em seguida, desative a opção " Menu de aplicativos " .

Em seguida, faça login novamente ou reinicie o shell do GNOME para ter certeza e você verá algo assim:

A caixa de diálogo que você está procurando agora é - confusamente - encontrada no menu App. Esse é o menu que aparece quando você clica no nome do aplicativo na barra superior da área de trabalho do Ubuntu 18.04, que é uma versão adaptada da área de trabalho do Gnome Shell. Ele é projetado para fornecer opções que se aplicam ao ambiente de aplicativos.

Como você mesmo experimentou, o design pode não ser tão afortunado. Os rumores são de que os desenvolvedores do Gnome Shell estão planejando mover esse menu de volta para dentro da janela do aplicativo.

Com algumas pesquisas, descobri que o comando

gsettings set org.gnome.gedit.preferences.editor display-line-numbers true

faz o truque para ativar os números de linha. Outras preferências do gedit também podem ser ajustadas. O comando

gsettings list-recursively | grep gedit

fornecerá uma lista de opções.

Referências:

https://howto8165.wordpress.com/2015/11/25/how-to-change-hidden-preferences-for-gedit/

configurar o gedit para sempre abrir em uma nova janela