No Office 365, 9 de ~130 contas de usuário recebem a licença Office 365 Enterprise E3 que, de acordo com https://technet.microsoft.com/en-GB/library/exchange-online-limits.aspx#StorageLimits , deve atribuir de armazenamento de 100 GB para as caixas de correio de usuário correspondentes, mas na verdade está atribuindo uma cota de armazenamento de 2 GB.
Não encontrei nada relevante online, por isso este post.
Isso foi resolvido definindo manualmente as cotas usando o comando Exchange Online PowerShell
Set-Mailbox <UPN> -ProhibitSendReceiveQuota 100GB -ProhibitSendQuota 100GB -IssueWarningQuota 98GB.Em uma nota relacionada, as caixas de correio de usuários afetadas e não afetadas por esse problema tiveram
UseDatabaseQuotaDefaults: False, de modo que parece ser normal.