Cron diariamente executando duas vezes

No meu servidor CentOS 7, erros gerados por um script de backup noturno que deveria funcionar bem me fizeram verificar minha atividade cron. Descobri que cron.dailyestá sendo executado duas vezes - aqui está a seção relevante /var/log/crondepois que removi meu script de backup para ver se de alguma forma estava causando o problema:

Oct 10 02:28:01 mail CROND[1750]: (root) CMD (run-parts /etc/cron.hourly)
Oct 10 02:28:01 mail run-parts(/etc/cron.hourly)[1750]: starting 0anacron
Oct 10 02:28:01 mail anacron[1759]: Anacron started on 2017-10-10
Oct 10 02:28:01 mail run-parts(/etc/cron.hourly)[1761]: finished 0anacron
Oct 10 02:28:01 mail anacron[1759]: Normal exit (0 jobs run)
Oct 10 02:30:01 mail CROND[1766]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 02:40:01 mail CROND[1847]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 02:50:01 mail CROND[1936]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 03:00:01 mail CROND[2032]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 03:10:01 mail CROND[2148]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 03:17:01 mail CROND[2223]: (root) CMD (run-parts /etc/cron.daily)
Oct 10 03:17:01 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2223]: starting kizunademo
Oct 10 03:17:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2259]: finished kizunademo
Oct 10 03:17:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2223]: starting logrotate
Oct 10 03:17:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2266]: finished logrotate
Oct 10 03:17:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2223]: starting man-db.cron
Oct 10 03:17:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2277]: finished man-db.cron
Oct 10 03:20:01 mail CROND[2288]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 03:28:01 mail CROND[2367]: (root) CMD (run-parts /etc/cron.hourly)
Oct 10 03:28:01 mail run-parts(/etc/cron.hourly)[2367]: starting 0anacron
Oct 10 03:28:01 mail anacron[2376]: Anacron started on 2017-10-10
Oct 10 03:28:01 mail run-parts(/etc/cron.hourly)[2378]: finished 0anacron
Oct 10 03:28:01 mail anacron[2376]: Will run job `cron.daily' in 35 min.
Oct 10 03:28:01 mail anacron[2376]: Jobs will be executed sequentially
Oct 10 03:30:01 mail CROND[2381]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 03:40:01 mail CROND[2462]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 03:50:02 mail CROND[2547]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 04:00:01 mail CROND[2670]: (root) CMD (/usr/lib64/sa/sa1 1 1)
Oct 10 04:03:01 mail anacron[2376]: Job `cron.daily' started
Oct 10 04:03:01 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2685]: starting kizunademo
Oct 10 04:03:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2721]: finished kizunademo
Oct 10 04:03:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2685]: starting logrotate
Oct 10 04:03:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2728]: finished logrotate
Oct 10 04:03:02 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2685]: starting man-db.cron
Oct 10 04:03:03 mail run-parts(/etc/cron.daily)[2739]: finished man-db.cron
Oct 10 04:03:03 mail anacron[2376]: Job `cron.daily' terminated
Oct 10 04:03:03 mail anacron[2376]: Normal exit (1 job run)

Por que está cron.dailyexecutando duas vezes? Como você pode ver, o log contém algumas entradas relacionadas à segunda execução que não estão presentes na primeira execução: duas linhas anunciando a próxima execução e mais duas linhas dizendo que terminou com uma saída normal. A primeira execução simplesmente executou os scripts sem alarde extra. Presumo que isso signifique alguma coisa, mas não sei o quê.

Verifiquei tudo o que pude pensar em busca de duplicatas de alguma coisa. Tenho certeza de que li todos os tópicos semelhantes sobre o assunto, então compare com o seguinte antes de chamar isso de pergunta duplicada. Baseado em Por que o cron está rodando duas vezes? Verifiquei processos extras - a saída completa ps aux | grep croné a seguinte, portanto, há apenas um processo:

root      9383  0.0  0.2 112672  2340 pts/0    S+   15:18   0:00 grep --color=auto cron
root     25624  0.0  0.0 126248   320 ?        Ss   Sep30   0:02 /usr/sbin/crond -n

Com base em trabalhos Cron rodando duas vezes - servidor Ubuntu 12.04 eu também verifiquei crontab -l -u root, que dizia no crontab for root.

E aqui está o meu /etc/crontab:

SHELL=/bin/bash
PATH=/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin
[email protected]

28 * * * * root run-parts /etc/cron.hourly
17 3 * * * root run-parts /etc/cron.daily
44 2 * * 0 root run-parts /etc/cron.weekly
8 2 7 * * root run-parts /etc/cron.monthly

Pensamentos?

EDIT (9 meses após esta discussão ter ficado em silêncio):

Comentário de hoje de Marin Velikov me fez saber que existe um anacrontabarquivo (sei que é bobo, mas nem tinha me ocorrido). Eis o seu conteúdo:

SHELL=/bin/sh
PATH=/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin
MAILTO=root
# the maximal random delay added to the base delay of the jobs
RANDOM_DELAY=45
# the jobs will be started during the following hours only
START_HOURS_RANGE=3-22

#period in days   delay in minutes   job-identifier   command
1       5       cron.daily              nice run-parts /etc/cron.daily
7       25      cron.weekly             nice run-parts /etc/cron.weekly
@monthly 45     cron.monthly            nice run-parts /etc/cron.monthly

Então essa é a causa. Mas por que o sistema seria configurado para executar ambos? Presumo que alguém mais esperto do que eu o tenha configurado dessa maneira, então hesito em mexer com ele antes de saber o propósito. E se eu realmente me livrar das entradas em crontabou anacrontab, qual é a melhor? Anacron é aparentemente a ferramenta mais sofisticada, mas parece estranho/errado esvaziar um arquivo crontab. Eu sou muito old-school?