Parece que o XenServer 6.5 foi lançado e é um pouco mais rápido que o 6.2 em muitos aspectos.
Quando instalei o 6.2, aceitei os vários padrões e acabei com um sistema particionado de maneira desajeitada. A raiz é bastante pequena (e sempre ficando sem espaço), enquanto uma partição de 250 Gb fica vazia. Para tanto estou pensando em fazer uma reconstrução com a v6.5.
Eu tenho lido sobre o processo e aparentemente você não pode misturar 6.2 e 6.5 no mesmo pool. Se eu retirar os membros do pool (3) um de cada vez, reconstruí-los e colocá-los em um novo pool, posso mover as várias VMs?
EDITAR:
Para atualizar o XenServer de 6.2 para 6.5 - comece com o mestre do pool e trabalhe em cada servidor. Se você fez uma repartição, não precisa fazer as etapas de edição novamente - contanto que você selecione 'atualizar' durante a instalação do 6.5, ele não reparticionará os discos.
O mestre do pool e os servidores no pool precisam ser da mesma versão do XenServer. Para responder à sua pergunta, sim, você pode remover um servidor por vez, atualizar, ingressar no pool e migrar as VMs. Como sempre, certifique-se de fazer um backup primeiro (exportar instantâneos) antes de executar a atualização.