carpediem's questions

Estou tentando visualizar os resultados da simulação com uma figura contendo 2 subplots usando matplotlib pyplot. Ambos devem conter animação: um usa a biblioteca netgraph (é um gráfico com nós mostrando os fluxos da rede) e o outro deve plotar um gráfico de linhas com outras 2 variáveis ​​(para simplificar, vamos usar: sin(x) e cos(x), onde ambos devem ser atualizados a cada período de tempo — assim como o gráfico). Tenho uma função de atualização para atualizar o gráfico, mas não tenho certeza de como atualizar o gráfico de linhas ao mesmo tempo. Agradeço sugestões.

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

from matplotlib.animation import FuncAnimation
from netgraph import Graph

# Simulate a dynamic network with
total_frames = 21
total_nodes = 5
NODE_LABELS = {0: 'A', 1: 'B', 2: 'C', 3: 'D', 4: 'E'}
NODE_POS = {0: (0.0, 0.5), 1: (0.65, 0.25), 2: (0.7, 0.5), 3: (0.5, 0.75), 4: (0.25, 0.25)}
adjacency_matrix = np.random.rand(total_nodes, total_nodes) < 0.25
weight_matrix = np.random.randn(total_frames, total_nodes, total_nodes)

# Normalise the weights, such that they are on the interval [0, 1].
vmin, vmax = -2, 2
weight_matrix[weight_matrix<vmin] = vmin
weight_matrix[weight_matrix>vmax] = vmax
weight_matrix -= vmin
weight_matrix /= vmax - vmin

cmap = plt.cm.RdGy

def annotate_axes(fig):
    for i, ax in enumerate(fig.axes):
        ax.tick_params(labelbottom=False, labelleft=False)

fig = plt.figure(figsize=(11, 6))

ax1 = plt.subplot2grid((6, 11), (0, 0), rowspan=6, colspan=5)
ax2 = plt.subplot2grid((6, 11), (1, 6), rowspan=2, colspan=5)

annotate_axes(fig)
title1 = ax1.set_title('Simulation viz', x=0.25, y=1.25)
title2 = ax2.set_title('Flow @t', x=0.15, y=1.25)

g = Graph(adjacency_matrix, node_labels=NODE_LABELS,
            node_layout = NODE_POS, edge_cmap=cmap, arrows=True, ax=ax1)

def update(ii):
    artists = []
    for jj, kk in zip(*np.where(adjacency_matrix)):
        w = weight_matrix[ii, jj, kk]
        artist = g.edge_artists[(jj, kk)]
        artist.set_facecolor(cmap(w))
        artist.update_width(0.03 * np.abs(w-0.5))
        artists.append(artist)
    return artists

animation = FuncAnimation(fig, update, frames=total_frames, interval=200, blit=True, repeat=False)
plt.show()

Estou tentando adicionar um número de quadro a uma visualização de simulação modificada daqui . Existe alguma maneira simples de adicionar um número de quadro a esta animação para que ela seja exibida como parte do título do enredo?

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

from matplotlib.animation import FuncAnimation
from netgraph import Graph

# Simulate a dynamic network with
total_frames = 10
total_nodes = 5
NODE_LABELS = {0: 'A', 1: 'B', 2: 'C', 3: 'D', 4: 'E'}
NODE_POS = {0: (0.0, 0.5), 1: (0.65, 0.25), 2: (0.7, 0.5), 3: (0.5, 0.75), 4: (0.25, 0.25)}
adjacency_matrix = np.random.rand(total_nodes, total_nodes) < 0.25
weight_matrix = np.random.randn(total_frames, total_nodes, total_nodes)

# Normalise the weights, such that they are on the interval [0, 1].
# They can then be passed directly to matplotlib colormaps (which expect floats on that interval).
vmin, vmax = -2, 2
weight_matrix[weight_matrix<vmin] = vmin
weight_matrix[weight_matrix>vmax] = vmax
weight_matrix -= vmin
weight_matrix /= vmax - vmin

cmap = plt.cm.RdGy

fig, ax = plt.subplots()
fig.suptitle('Simulation viz @ t=', x= 0.15, y=0.95)
g = Graph(adjacency_matrix, node_labels=NODE_LABELS,
            node_layout = NODE_POS, edge_cmap=cmap, arrows=True, ax=ax)

def update(ii):
    artists = []
    for jj, kk in zip(*np.where(adjacency_matrix)):
        w = weight_matrix[ii, jj, kk]
        artist = g.edge_artists[(jj, kk)]
        artist.set_facecolor(cmap(w))
        artist.update_width(0.03 * np.abs(w-0.5))
        artists.append(artist)
    return artists

animation = FuncAnimation(fig, update, frames=total_frames, interval=200, blit=True, repeat=False)
plt.show()

Obrigado. Eu apreciaria qualquer ajuda/sugestão.

Estou tentando criar uma simulação pyplot usando plt.pause() mas não consigo fazer nem o exemplo mais simples funcionar. Este é o código :

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

np.random.seed(19680801)
data = np.random.random((50, 50, 50))

fig, ax = plt.subplots()

for i, img in enumerate(data):
    ax.clear()
    ax.imshow(img)
    ax.set_title(f"frame {i}")
    plt.pause(0.1)

O problema parece ter algo a ver com a última linha do código (plt.pause(0.1)). Sem esta linha, a saída final mostra o quadro final da simulação – quadro 49 (indicando que todo o loop foi concluído). Se eu incluir a linha final e executar a simulação, a saída para no primeiro quadro – quadro 0 (e a simulação não avança para a próxima etapa do loop). Também tentei definir plt.pause(0.0) mas teve exatamente o mesmo efeito que defini-lo para qualquer outro número.

Estou no Mac, usando python 3.12 no Jupyter Notebook 7.2.1. Eu agradeceria qualquer conselho. Obrigado.