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Início / coding / Perguntas / 79075411
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farrow90
farrow90
Asked: 2024-10-11 00:45:09 +0800 CST2024-10-11 00:45:09 +0800 CST 2024-10-11 00:45:09 +0800 CST

Calculando percentuais cumulativos em R para múltiplas colunas

  • 772

Suponha que eu tenha uma cadeia de Markov de tempo discreto. Estou interessado em simular a Cadeia de Markov em múltiplas iterações e observar a distribuição estacionária (ou seja, em um longo período de tempo, porcentagem de tempo gasto em todos os estados).

Este é o código R que estou usando atualmente.

Aqui está a Cadeia de Markov:

library(ggplot2)
library(reshape2)  


transition_matrix <- matrix(c(
    0.7, 0.2, 0.1,  # Probabilities of transitioning from A to A, B, C
    0.3, 0.4, 0.3,  # Probabilities of transitioning from B to A, B, C
    0.2, 0.3, 0.5   # Probabilities of transitioning from C to A, B, C
), nrow = 3, byrow = TRUE)


initial_vector <- c(1/3, 1/3, 1/3)

Tentei simular isso da seguinte maneira:

set.seed(123) 
n_simulations <- 1000
states <- numeric(n_simulations)
current_state <- sample(1:3, 1, prob = initial_vector)

for (i in 1:n_simulations) {
    states[i] <- current_state
    current_state <- sample(1:3, 1, prob = transition_matrix[current_state,])
}

state_names <- c("A", "B", "C")
states_letter <- state_names[states]

df <- data.frame(
    time = 1:n_simulations,
    state = states_letter
)

Por fim, preparo os dados para plotagem:

cumulative_percentage <- data.frame(
    time = 1:n_simulations,
    A = cumsum(states_letter == "A") / 1:n_simulations * 100,
    B = cumsum(states_letter == "B") / 1:n_simulations * 100,
    C = cumsum(states_letter == "C") / 1:n_simulations * 100
)

cumulative_percentage_melted <- melt(cumulative_percentage, id.vars = "time", 
                                     variable.name = "state", value.name = "percentage")

p2 <- ggplot(cumulative_percentage_melted, aes(x = time, y = percentage, color = state)) +
    geom_line() +
    theme_minimal() +
    labs(title = "Cumulative Percentage of Time Spent in Each State",
         x = "Time Step",
         y = "Cumulative Percentage",
         color = "State") +
    theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5)) +
    ylim(0, 100)

p2

state_proportions <- table(states_letter) / n_simulations
print(state_proportions)

insira a descrição da imagem aqui

Existe uma maneira de alterar meu código para que eu não precise definir manualmente A == cumsum, B == cumsum etc etc e fazer isso para todos os estados?

  • 1 1 respostas
  • 31 Views

1 respostas

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  1. Best Answer
    AkselA
    2024-10-11T02:07:32+08:002024-10-11T02:07:32+08:00

    Seu forloop de simulação não fez muito sentido para mim, então eu criei o meu próprio. Provavelmente longe do ideal, mas o bit de proporção cumulativa eu ​​acho que está OK, aproveitando o quão "vetorizado" R é.

    # Transition matrix
    states <- LETTERS[1:3]
    tran <- matrix(c(
        0.7, 0.2, 0.1,  # Probabilities of transitioning from A to A, B, C
        0.3, 0.4, 0.3,  # Probabilities of transitioning from B to A, B, C
        0.2, 0.3, 0.5   # Probabilities of transitioning from C to A, B, C
    ), nrow=3, byrow=TRUE, dimnames=list(from=states, to=states))
    
    # Simulation
    nsim <- 1e3
    sim <- numeric(nsim)
    sim[1] <- 1 # Initial state
    simseq <- seq_len(nsim)
    
    set.seed(1)
    for (i in seq_len(nsim-1)) {
        sim[i+1] <- sample(1:3, 1, prob=tran[sim[i],])
    }
    
    # Cumulative proportion
    m <- matrix(0, ncol=3, nrow=nsim)
    m[cbind(simseq, sim)] <- 1
    cumprop <- apply(m, 2, cumsum)/simseq
    
    # Plotting
    par(mar=c(3, 3, 1, 1), mgp=c(1.8, 0.6, 0))
    matplot(cumprop, type="l", lty=1, xlab="Step n", ylab="Cumulative proportion")
    legend("topright", states, lty=1, col=1:3, title="State")
    

    insira a descrição da imagem aqui

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