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Início / coding / Perguntas / 77691456
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cicciodevoto
cicciodevoto
Asked: 2023-12-20 20:07:09 +0800 CST2023-12-20 20:07:09 +0800 CST 2023-12-20 20:07:09 +0800 CST

Erro ao ler uma única coluna de um arquivo CSV enorme com mecanismo Pandas e PyArrow

  • 772

Estou tentando ler no Pandas uma única coluna de um enorme arquivo CSV usando a resposta de outra pergunta :

import pandas as pd

test_df = pd.read_csv("test.csv", usecols=["id_str"], engine="pyarrow")

e obtenho este erro:

pyarrow.lib.ArrowInvalid: CSV parse error: Expected 4 columns, got 3

Usando um arquivo muito menor, posso lê-lo sem pd.read_csvnenhuma opção.

Lendo em volta parece que esse problema está relacionado ao fato do arquivo CSV possuir células vazias, que são preenchidas NaNquando pd.read_csvusado sem opções, mas criam problemas no outro caso.

Ainda não encontrei nenhuma solução para esse problema, alguma sugestão?

Quero ler apenas algumas colunas, porque o arquivo é muito grande e preciso apenas delas para a análise que tenho que fazer.

python
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    KingOtto
    2023-12-20T20:17:25+08:002023-12-20T20:17:25+08:00

    Seu arquivo CSV está quebrado. Em algum lugar no arquivo, você tem um número incorreto de vírgulas... então há menos colunas do que o pandas esperaria. Você não pode reproduzir esse erro com um arquivo menor (diferente), porque esses dados menores (por exemplo, apenas as 100 primeiras linhas) estão formatados corretamente - portanto, seu código funciona. Em algum lugar abaixo do arquivo original, pelo menos uma linha não se parece com as linhas acima e isso causa o erro (apenas no arquivo original).

    Não se trata de valores ausentes (por exemplo, np.NaNrepresentado em csv como ",,"). Eles podem ser analisados. Trata-se do número incorreto de vírgulas seguidas.

    Suponha que você queira consertar o arquivo, você precisará encontrar a linha quebrada (e removê-la ou corrigir o conteúdo). Tente ler apenas um certo número de linhas (100, 500, 1000, ..) até encontrar o erro. Isso permitirá que você encontre a linha. Ou faça uma cópia do arquivo e exclua os 90% inferiores, os 80% inferiores, .. até que o erro apareça.

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