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justaguy
Asked: 2019-03-29 07:51:24 +0800 CST

awk 根据变量匹配提取文件中的特定模式

  • 772

在awk下面，我试图RSTRING根据另一个变量的值$VCF在file. 的值$VCF已被提取，RSTRING当前是所有以 开头的行R_2019。我想要得到的是RSTRING根据$VCF找到的地方设置的。谢谢 ：）。

文件

xxx_0000 19-0004-La-Fi
xxx_0001 19-0005-Last-Firs
xxx_0003 19-0008-LastN-FirstN
xxx_0005 190320-Control
R_2019_00_00_xxxx-000-v5.6_xxxxx

xxx_0007 19-0000-LastName-FirstName
xxx_0009 19-0001-Las-Fir
xxx_0011 190319-Control
R_2019_00_00_xxxx-00-v5.6_xxxxx

如果$VCF=19-0008-LastN-FirstN

想要的 

RSTRING=R_2019_00_00_xxxx-000-v5.6_xxxxx

如果$VCF=19-0008-Las-Fir

想要的 

RSTRING=R_2019_00_00_xxxx-00-v5.6_xxxxx

awk

awk -v ref="$VCF" 'match($0, ref) {print "$RSTRING"}' file
awk

1 个回答

  1. Best Answer

    两种选择：

    1. 逐行读取文件，找到 VCF 时设置一个布尔标志，然后打印下一个RSTRING：

      awk -v ref="$VCF" '
    $0 ~ ref {have_vcf = 1}
    have_vcf && /^R_2019/ {print; have_vcf = 0}
' file

    2. 按段落阅读文件。如果当前记录包含 VCF，则打印记录的最后一个字段：

      awk -F '\n' -v RS="" -v ref="$VCF" '$0 ~ ref {print $NF}' file
    • 1

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