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主页 / coding / 问题 / 78604674
Accepted
Joshua Shew
Joshua Shew
Asked: 2024-06-11 06:03:36 +0800 CST2024-06-11 06:03:36 +0800 CST 2024-06-11 06:03:36 +0800 CST

在 R 中可以为“R_MAX_VSIZE”输入什么值?

  • 772

我正在 R 中进行内存密集型操作。我在这个网站上看到了一些关于增加内存限制的建议,R_MAX_VSIZE但我还没有找到关于可以输入哪些类型的值以及如何读取它们的明确解释。

环境变量接受/有效的格式是什么R_MAX_VSIZE?

以下是我目前发现的内容:

  1. R 基础文档 - 内存:可用于数据存储的内存

    最大向量堆大小可以通过环境变量设置R_MAX_VSIZE

    我在此帮助页面上找不到有关允许使用哪些值的更多信息。

  2. Graeme Frost在 MacOS 上对R 的回答错误:矢量内存耗尽(达到限制?)

    这个答案建议将值设置为“100Gb”。当我在自己的机器上遇到这个问题时,这实际上解决了我的问题,但还有其他答案表明其他值是有效的。

  3. Connor Dibble对错误的回答:向量内存耗尽(达到限制?)R 3.5.0 macOS

    这个答案设置的值export R_MAX_VSIZE=32000000000不包含单位,所以我假设它被解释为字节。

  • 1 1 个回答
  • 26 Views

1 个回答

  • Voted
  1. Best Answer
    Justin Singh-M.
    2024-06-11T06:31:58+08:002024-06-11T06:31:58+08:00

    至少自撰写本文时的 R-devel (4.5.0) 以来,涵盖的内存R_MAX_VSIZE章节已更新为包含其值应为的内容:

    向量堆限制以字节为单位给出。

    然而,在 R 的源代码(至少是它的镜像)中,我们可以看到从环境变量检索到的值被传递给R_Decode2Long:

    if ((p = getenv("R_MAX_VSIZE"))) {
    value = R_Decode2Long(p, &ierr);
    

    在此函数的定义中,还解释了带有单位的值(即 100G、20M 等):

    R_size_t R_Decode2Long(char *p, int *ierr)
    {
        R_size_t v = strtol(p, &p, 10);
        *ierr = 0;
        if(p[0] == '\0') return v;
        /* else look for letter-code ending : */
        if(R_Verbose)
        REprintf("R_Decode2Long(): v=%ld\n", (long)v);
        // NOTE: currently, positive *ierr are not differentiated in the callers:
        if(p[0] == 'G') {
        if((Giga * (double)v) > (double) R_SIZE_T_MAX) { *ierr = 4; return(v); }
        return (R_size_t) Giga * v;
        }
        else if(p[0] == 'M') {
        if((Mega * (double)v) > (double) R_SIZE_T_MAX) { *ierr = 1; return(v); }
        return (R_size_t) Mega * v;
        }
        else if(p[0] == 'K') {
        if((1024 * (double)v) > (double) R_SIZE_T_MAX) { *ierr = 2; return(v); }
        return (1024*v);
        }
        else if(p[0] == 'k') {
        if((1000 * (double)v) > (double) R_SIZE_T_MAX) { *ierr = 3; return(v); }
        return (1000*v);
        }
        else {
        *ierr = -1;
        return(v);
        }
    }
    
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