Estou usando o wget para baixar arquivos, mas aparentemente ele fornece o arquivo HTML em vez do arquivo que preciso.
minha versão do wget é GNU Wget 1.19.1 construída no linux-gnu e aqui está a linha de comando que usei:
wget --user=... --password=... https://transfer.usz.ch/messages/O6Xk6MAxMUYYIql5OTSRlo/attachments/dgzQv5Nl8Sv1eS6GDdtY3S/download/B201643229_T_S60_sort_merge_dup_recal_RGtag.bam
Eu me pergunto o que deu esse erro.
No site que você vinculou, parece que você espera que o wget passe seu nome de usuário e senha fornecidos para o formulário no site; wget não suporta isso.
Os argumentos
--user
e--password
destinam-se a ser usados para autenticação básica FTP ou HTTP, conforme indicado no manual do wget.Veja esta pergunta para obter mais informações sobre como realizar o que você está tentando fazer: Baixar o site HTTPS disponível apenas por meio de nome de usuário e senha com wget?