Geralmente é seguro compilar e instalar manualmente um novo kernel do kernel.org usando:
make -j 8
make install
make modules_install
ou a distribuição, por exemplo, Debian, pode quebrar, porque assume que gerencia atualizações do kernel por meio de apt?
Intuitivamente, tudo deve continuar funcionando, pois o kernel preserva uma API syscall estável e os drivers são compatíveis com versões anteriores.
Sim, é seguro; O Debian não requer um kernel empacotado e, como você diz, o kernel é compatível com versões anteriores. Você só precisa ter certeza de que sua configuração do kernel está funcional.
No entanto, você pode compilar um pacote do kernel a partir da fonte do kernel upstream e instalar os pacotes resultantes. Execute isso na árvore de origem do kernel, em vez de
make install modules_install:Veja também o manual do kernel do Debian que explica como construir pacotes do kernel em uma variedade de cenários.