Quais são as diferenças entre as atualizações da lista do yum e os obsoletos da lista do yum?

Você normalmente não tem todos os pacotes do repositório em seu sistema local, mas apenas um subconjunto deles.

yum list updateslista todos os pacotes nos repositórios que possuem atualizações. Este é um superconjunto dos pacotes em seu sistema que possuem atualizações disponíveis.

O comando usual para verificar se há atualizações para os pacotes em seu sistema é yum check-update, que tem a seguinte descrição na página man (ênfase minha):

Implementado para que você possa saber se sua máquina tem alguma atualização que precisa ser aplicada sem executá-la interativamente. Retorna o valor de saída de 100 se houver pacotes disponíveis para uma atualização. Também retorna uma lista dos pacotes a serem atualizados em formato de lista. Retorna 0 se nenhum pacote estiver disponível para atualização. Retorna 1 se ocorreu um erro. A execução no modo detalhado também mostra obsoletos .

Uma diferença interessante entre yum list obsoletese yum check-updateé que o comando anterior também aceita uma expressão glob para restringir a lista de pacotes que podem estar obsoletos por pacotes nos repositórios. yum check-updatenão aceita tal expressão glob.