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Anna1364
Asked: 2019-06-13 11:08:55 +0800 CST

como gerar uma coluna para um arquivo combina com caracteres exclusivos no nome do arquivo?

  • 772

eu tenho um monte de arquivos

an_ar_chrom10_pos1_sun_td.txt
an_ar_chrom11_pos1_sun_td.txt
an_ar_chrom13_pos1_sun_td.txt
an_ar_chrom17_pos1_sun_td.txt
an_ar_chrom17_pos2_sun_td.txt
...

e cada arquivo tem formato semelhante parece com isso

head an_ar_chrom10_pos1_sun_td.txt
    "region" "start" "stop" "mid" "G1_TD" "G2_TD" "G3_TD" "G4_TD"
    "45000002 - 45010001 " 45000002 45010001 90.010003 NA NA NA NA
    "45010002 - 45020001 " 45010002 45020001 90.030003 -1.19087678772119 -0.947895467698369 -0.724767209958411 -0.957244005901499
    "45020002 - 45030001 " 45020002 45030001 90.050003 NA NA NA NA
    "45030002 - 45040001 " 45030002 45040001 90.070003 NA NA NA NA

Desejo adicionar uma coluna extra a cada arquivo com base em alguns caracteres exclusivos em cada nome de arquivo (por exemplo, chrom10_pos1 para o primeiro arquivo, chrom11_pos1 para o segundo arquivo, etc.

Esta é a minha saída desejada

head an_ar_chrom10_pos1_sun_td_with_id.txt
"region" "start" "stop" "mid" "G1_TD" "G2_TD" "G3_TD" "G4_TD" "ID_
"45000002 - 45010001 " 45000002 45010001 90.010003 NA NA NA NA chrom10_pos1
"45010002 - 45020001 " 45010002 45020001 90.030003 -1.19087678772119 chrom10_pos1-0.947895467698369 -0.724767209958411 -0.957244005901499 chrom10_pos1
"45020002 - 45030001 " 45020002 45030001 90.050003 NA NA NA NA chrom10_pos1
"45030002 - 45040001 " 45030002 45040001 90.070003 NA NA NA NA chrom10_pos1
text-processing

1 respostas

  1. Best Answer

    Eu o abordaria com um editor de script e um loop de shell sobre os nomes dos arquivos:

    for f in *.txt
do
  value=$(printf '%s' "$f" | cut -d_ -f 3-4)
  printf '%s\n' '1s/$/ "ID"/' '2,$s/$/ '"$value"'/' 'wq' | ed -s "$f"
done

    Isso faz um loop sobre todos os arquivos "*.txt" em seu diretório atual e os edita. A primeira linha do loop extrai os dados desejados do nome do arquivo em uma variável. A segunda linha imprime três comandos para ed:

    1. 1s/$/ "ID"/-- altera a linha 1 para anexar o novo cabeçalho da coluna
    2. 2,$s/$/ $value/(simplificado a partir do valor citado) -- nas linhas dois até o final do arquivo, substitua o final da linha por um espaço e os dados desejados.
    3. wq-- grava o arquivo no disco e sai
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